Analýza směrovosti neuritů

Loading...
Thumbnail Image
Date
ORCID
Mark
C
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Práca je zameraná na navrhnutie vhodnej metódy analýzy smerovosti neuritov. Využité boli snímky neurónov z fluorescenčnej mikroskopie. Pred samotnou segmentáciou bolo potrebné snímky predspracovať, pričom sa postupne využila úprava kontrastu, ostrenie a adaptívna filtrácia pomocou Weinerovského filtru. Jednotlivé návrhy metód segmentácie pozostávali z prostého prahovania, narastaním oblastí a využitím morfologických operácií. Následná analýza smerovosti využívala smer gradientov v obraze. Navrhnutá metóda bola využitá aj ako klasifikátor, ktorý dokázal rozdeliť jednotlivé snímky do skupín podľa smeru rastu.
The thesis is focused on the design of a suitable method for analyzing the directionality of neurites. Fluorescence microscopy images of neurons were used. Prior to segmentation, the images had to be preprocessed, using contrast adjustment, sharpening, and adaptive filtering using a Weiner filter.The individual proposals of segmentation methods consisted of simple thresholding, area growth and the use of morphological operations. Subsequent directionality analysis used the direction of the gradients in the image. The proposed method was also used as a classifier, which was able to segregate the respective images into classes according to the direction of the growth.
Description
Citation
PLIŠKOVÁ, D. Analýza směrovosti neuritů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2021.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
en
Study field
bez specializace
Comittee
doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (předseda) Ing. Martin Mézl, Ph.D. (místopředseda) Mgr. Bc. Darina Čejková, Ph.D. (člen) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen) Ing. Filip Plešinger, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2021-06-09
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Diskutovaný bol vplyv postupne různeho smeru neuritu na výsledky. Ing. Mézl sa dotázal na vhodnosť MSE a možnosť prvotného potlačenia šumu a následného ostrenia. Doc. Kolářová sa dotázala na praktické využitie. Ing. Plešinger sa dotázal na veľkosť datasetu. Studentka obhájila diplomovou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení
DOI
Collections
Citace PRO