Identifikace nekódující RNA u Clostridium beijerinckii NRRL B-598 pomocí RNA-Seq dat
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
C
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Tato bakalářská práce obsahuje stručný úvod do problematiky nekódujících malých RNA u bakterií (sRNA). Zaměřuje se na jejich vlastnosti a funkce v organismu a to konktrétně pro bakterii Clostridium beijerinckii NRRL B-598. Dále obsahuje popis laboratorních metod pro stanovení genové exprese a navrhuje postup pro identifikaci malých nekódujících RNA z dat získaných metodou RNA-Seq, pro zkoumanou bakterii Clostridium beijerinckii NRRL B-598. V neposlední řadě dochází k implementaci navrženého postupu v prostředí MATLAB a zhodnocení výsledků získaných touto metodou.
This bachelor thesis contains short introduction into bacterial small non-coding RNA problematic. It is oriented on their features and functions in organisms, especially in bacteria Clostridium beijerinckii NRRL B-598. Bachelor thesis also contains description of various laboratory methods for gene expression determination and suggests a detection method for small non-coding RNA in bacteria Clostridium beijerinckii NRRL B-598. Suggested method works with data, which were obtained by RNA-Seq technology. Within the framework of the bachelor thesis was suggested method implemented in programming and numeric computing platform MATLAB and its results were discussed.
This bachelor thesis contains short introduction into bacterial small non-coding RNA problematic. It is oriented on their features and functions in organisms, especially in bacteria Clostridium beijerinckii NRRL B-598. Bachelor thesis also contains description of various laboratory methods for gene expression determination and suggests a detection method for small non-coding RNA in bacteria Clostridium beijerinckii NRRL B-598. Suggested method works with data, which were obtained by RNA-Seq technology. Within the framework of the bachelor thesis was suggested method implemented in programming and numeric computing platform MATLAB and its results were discussed.
Description
Citation
POMYKALOVÁ, B. Identifikace nekódující RNA u Clostridium beijerinckii NRRL B-598 pomocí RNA-Seq dat [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2021.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
bez specializace
Comittee
doc. Ing. Jiří Hozman, Ph.D. (předseda)
prof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D. (místopředseda)
Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (člen)
Ing. Kateřina Jurečková (člen)
MUDr. Jaromír Gumulec, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2021-06-17
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Prof. Provazník položil otázku, co je replikát a pokrytí? Doc. Hozman položil otázku, jaké jsou zdroje chyb? Studentka obhájila bakalářskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení