SEDLÁŘ, K. Metody pro komparativní analýzu metagenomických dat [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2018.

Posudky

Posudek vedoucího

Provazník, Ivo

Disertační práce Ing. Karla Sedláře je zaměřena na bioinformatické metody metagenomického výzkumu v oblasti mikrobiologie. Jsou zde rozvíjeny možnosti vizualizace pomocí bipartitních grafů aplikované na data z cílené sekvenace s cílem dosáhnout kvalitativní i kvantitativní analýzy složení mikrobiální sítě. Rovněž jsou rozvíjeny možnosti matagenomického binningu pro analýzu rozsáhlých datasetů i dat z nejmodernějších sekvenačních technologií. Na základě předložené práce mohu konstatovat, že autor splnil cíle stanovené v tezích disertační práce a dosáhl zaznamenáníhodných výsledků. Ing. Sedlář pracoval po celou dobu svého doktorského studia velmi aktivně a prokázal schopnost samostatné tvůrčí práce včetně schopnosti prezentovat dosažené výsledky. Dosáhl cenných výsledků ve formě řady kvalitních časopiseckých publikací včetně zveřejnění jádra disertace v článku v impaktovaném časopisu. Oceňuji také jeho kritický přístup k hodnocení vlastních výsledků. Během doktorského studia spolupracoval z významnými firmami působícími v oboru a vyvíjel efektivní metody pro sestavování genomů. Rovněž navázal spolupráci s několika českými špičkovými pracovišti a v oblasti bakteriální metagenomiky nebo vyhledávání genů či hodnocení genové exprese v biotechnologických aplikacích. Jsem přesvědčen, že Ing. Sedlář vypracoval hodnotnou disertační práci a dosáhl vědecké úrovně potřebné k udělení titulu doktor.

Navrhovaná známka

Posudek oponenta

Vinař,, Tomáš

viz příloha pdf

Navrhovaná známka

Lexa, Matej

viz příloha pdf

Navrhovaná známka

eVSKP id 113349