ČARNECKÁ, M. Molekulární studium intracelulárních změn vyvolaných reakcí mikroorganismů na vnější prostředí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2009.
Ing. Martina Čarnecká zahájila prezenční doktorské studium ve studijním programu "Chemie a technologie ochrany životního prostředí" od 1.9.2006. Disertační práce byla řešena v laboratořích Ústavu chemie potravin a biotechnologií FCH VUT v Brně. Práce prezentovaná v anglickém jazyce byla předložena k obhajobě v říjnu 2009. V rámci prezenční formy doktorského studia doktorandka splnila veškeré předepsané zkoušky i výukové požadavky. Podílela se na výuce Praktika z instrumentální a strukturní analýzy, Praktika z biochemie a Praktika z biotechnologie. V průběhu doktorského studia absolvovala ing. Čarnecká 7-měsíční pobyt v rámci programu Socrates/Erasmus na Universitě v ve Vídni (Rakousko) (Švédsko), kde pracovala pod vedením dr. J. Gregana (Max perutz Laboratories, University Wienna). V průběhu zahraničního pobytu zpracovala část experimentů disertační práce zaměřených na specializované genoické experimenty. Po celou dobu studia rovněž doktorandka intenzivně spolupracovala s Fakultou biochemickej a potravinárskej technológie STU a s Chemickým ústavem SAV v Bratislavě. Dále absolvovala ing. Čarnecká řadu specializovaných kurzů (př. urz proteomických technik) a krátkodobých stáží na odborných pracovištích v ČR. Po celou dobu studia projevovala doktorandka vysoký zájem o studovanou problematiku a mimořádnou schopnost samostatné tvůrčí práce. Ing. Čarnecká zvládla v průběhu experimentální části své disertační práce řadu nejmodernějších instrumentálních technik, a to nejen z hlediska provedení experimentu, ale i s ohledem na interpretaci často poměrně náročných problémů . V práci jsou účelně zkombinovány klasické a vysoce moderní metody a techniky od různých typů kultivačních technik přes postupy zpracování biologického materiálu, extrakční procedury, chromatografické separace, pulsní gelovou elektroforézu, hmotnostní spektrometrie ESI-MS a rovněž řadu technik genového inženýrství včetně fluorescenční mikroskopie. Reference na práci ing. Čarnecké na českých i zahraničních zahraničním pracovištích byly vždy vysoce kladné. Obzvláště je třeba hodnotit i její schopnost týmové práce, kolegialitu a vstřícný přístup ke spolupracovníkům zejména ve studentských týmech. V průběhu DSP se disertantka podílela na řešení řady projektů v rámci FCH. Byla zapojena při řešení výzkumného záměru FCH MSM 0021630501, byla členem řešitelského týmu projektu GA AV IAA400310506 "Systémy mikrofluidiky a hmotností spektrometrie pro diferenciální proteomickou a metabolickou analýzu průmyslově významných mikroorganismů" a v roce 2008 získala grant FRVŠ 2541/G4/2008 s názvem "Komplexní analýza změn kvasinek v průběhu regulované produkce sekundárních metabolitů". Poslední dva granty byly již ukončeny a úspěšně obhájeny. Dosažené výsledky byly prezentovány formou 4 uveřejněných publikací v mezinárodních časopisech a 3 aktuálně posuzovaných rukopisů, dále formou 28 příspěvků na mezinárodních konferencích a konferencích s mezinárodní účastí konaných v ČR a SR. Získané výsledky byly shrnuty v nadstandardní disertační práci, která dokumentuje tvůrčí přístup k práci, vysokou odbornou úroveň a široký přehled ing. Čarnecké ve studované tématice. Zavedené metody a komplexní postupy mohou být s malými modifikacemi využity i v dalších pracech a část experimentů má i přímý praktický výstup. Vzhledem k výše uvedeným skutečnostem a v souladu s platnou legislativou doporučuji, aby byla disertační práce přijata k obhajobě a po jejím úspěšném obhájení byla ing. Čarnecké udělena vědecká hodnost Ph.D.
Předložená dizertace má charakter experimentální práce, je členěna do 8 kapitol dle běžných zvyklostí. Celkem je sepsána na 120 stranách, je tvořena textem, tabulkami, grafy a obrázky. V hustě psané práci se ztrácí její význam a je snížena její přehlednost. Teoretická část zaujímá 52 stran. Z předložené dizertační práce nevyplývá, zda-li doktorandka absolvovala doktorské studium v jazyce českém nebo anglickém. Vzhledem k tomu, že je dizertační práce předkládána na české vysoké škole, měla by tato práce obsahovat alespoň česky psaný souhrn a klíčová slova. Desky práce jsou uvedeny dvoujazyčně. V práci chybí podpis dizertantky. Cíle práce jsou shrnuty do 3 dílčích úkolů. Experimentální část obsahuje použité chemikálie, materiál, přístroje a použitý materiál. V této části postrádám sdělení o počtu opakování jednotlivých způsobů testování, počtu případů atd. Zcela postrádám kapitolu o použití matematicko-statistických metod, které dokladují významnost dosažených výsledků. K popisu experimentů, použitému materiálu, pracovním postupům nemám zásadních připomínek, neboť vycházejí z ověřených postupů. Výsledky a diskuze jsou uvedeny na s. 66 - 111. Výsledky jsou členěny podle jednotlivých experimentů, jsou jasně formulovány. Předkládané tabulky jsou přehledné, jednoduché grafy a obrázky jsou na vysoké úrovni. Mám připomínku k použití řádkování 1 při psaní textu a hustě uložených grafů a obrázků, text splývá, unikají detaily. Obrázky uvedené na s. 99 a 100 by mohly být uvedeny méně syté, nebo raději uvést, že výsledky uvedené v obr. 61-63, 69 a 71 jsou shodné, nevýznamné apod. Závěry a doporučení pro další rozvoj vědy a pro praxi jsou shrnuty do 8 teoretických i praktických souhrnů, vycházejí z dosažených výsledků, jsou dostačující, výstižné a mohou sloužit pro další zkoumání dané problematiky. K této části nemám připomínek. Použitá literatura je tvořena 85 citacemi domácích a zahraničních autorů. Celkové zhodnocení dizertační práce: Předkládaná dizertační práce řeší významnou problematiku, přináší řadu nových, zpřesňujících a doplňujících vědeckých poznatků. Je sepsána čtivě, tabulky, grafy a obrazky jsou na vysoké úrovni a výstižně doplňují vědecká poznání. Drobné připomínky nikterak nesnižují vysokou odbornou úroveň práce. Závěr Předložená dizertační práce Ing. Martiny Čarnecké splňuje po stránce vědecké, obsahové a formální požadavky stanovené příslušnými vyhláškami pro získání vědecko-akademické hodnosti. Na základě uvedeného navrhuji, po úspěšné obhajobě udělení vědecko-akademické hodnosti "philosophiae doctor" (PhD.).
eVSKP id 28309