JUREČKOVÁ, K. Software pro extrakci genomických dat z GenBank formátu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.
Studentka Kateřina Jurečková vypracovala kvalitní bakalářskou práci na téma Software pro extrakci genomických dat z genbank formátu. Během semestru studentka pravidelně konzultovala, k řešení práce přistupovala zodpovědně a iniciativně. Z formálního hlediska je práce na přijatelné úrovni, bohužel první dvě strany textu obsahují množství gramatických chyb, v dalším textu se však chyby vyskytují minimálně. Některé obrázky jsou zbytečně velké a většina obrázků není zmíněna v textu. Sloupcové grafy z praktické části práce mohly mít stejné měřítko, aby šly lehce porovnávat. Literární zdroje jsou správně citovány a jejich množství je dostatečné. Všechny body zadání byly splněny. Vytvořená uživatelská aplikace pro extrakci dat z genbank formátu je funkční. Následná doplňková analýza extrahovaných dat srovnává vnitrorodové variability vybraných úseků mtDNA. Výsledky jsou správně diskutovány.
Práce studentky Kateřiny Jurečkové je tematicky rozdělena na dva celky. Jedním je návrh a realizace aplikace umožňují extrakci dat z datového formátu GenBank a druhým je vyhodnocení genetické variability mitochondriálních genů. V práci však chybí dostatečné propojení obou celků. Zejména pak teoretická část práce je zaměřena pouze na první z nich. Hodnota získaných výsledků o genetické variabilitě je tak diskutabilní, což podtrhuje i místy příliš vágní slovní zhodnocení např. „strom zhruba odpovídá“ apod. Vyhodnocení míry variability nevyužívá standardní kritéria k tomu určená (např. informační obsah, znaková entropie) a nezohledňuje nesourodou velikost jednotlivých datasetů. Drobné nedostatky práce shledávám i ve výskytu gramatických a stylistických chyb v textu, chybějícímu popisu parametrů zarovnání sekvencí, neodlišení latinských názvů taxonomických skupin kurzívou a nestandardně řazeném seznamu referencí. Až na zmíněné nedostatky hodnotím práci jako velmi dobrou.
eVSKP id 84354