HRAZDILOVÁ, I. Analýza dat ze sekvenování příští generace ke studiu aktivity transposonů v nádorových buňkách [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.
Diplomová práce Bc. Ivany Hrazdilové se zabývá velice aktuální problematikou využití dat ze sekvenování příští generace pro řešení zajímavých biologických či medicínských otázek, v tomto případě otázky aktivity transposonů v nádorových buňkách. Diplomová práce obsahuje velmi bohatou rešerši zaměřenou na aktivitu transposonů a jejich souvislost s nádorovými onemocněními. Jádrem práce je využití dostupných programů, jejich optimalizace či vytvoření vlastních nástrojů k analýze aktivity transposonů v nádorových buňkách ve srovnání se zdravými buňkami. To vše s využitím dat nacházejících se v dostupných databázích. Diplomantka získala originální výsledky jasně ukazující, že transposony jsou aktivnější v nádorových buňkách než v buňkách zdravých. Splnila tak zadání práce, i když je škoda, že z časových důvodů nebylo možné provést analýzy dalších dat (důvod snižení bodového ohodnocení). Práce nicméně jasně ukázala, že touto cestou se mohou ubírat další analýzy a související výzkum. Diplomantka se vyznačovala zájmem o problematiku, aktivitou, pracovitostí a schopností samostatně řešit zadanou problematiku. Prokázala schopnost pracovat s literaturou, výsledky správně interpretovat a začlenit do současného stavu poznání.
Posudek včetně otázek k obhajobě je přiložen v souboru.
eVSKP id 65473