Browsing by Author "Jurečková, Kateřina"
Now showing items 1-9 of 9
-
Acidogenesis, solventogenesis, metabolic stress response and life cycle changes in Clostridium beijerinckii NRRL B-598 at the transcriptomic level
Patáková, Petra; Branská, Barbora; Sedlář, Karel; Vasylkivska, Maryna; Jurečková, Kateřina; Kolek, Jan; Cicková, Pavlína; Provazník, Ivo (Springer Nature, 2019-02-04)Clostridium beijerinckii NRRL B-598 is a sporulating, butanol and hydrogen producing strain that utilizes carbohydrates by the acetone-butanol-ethanol (ABE) fermentative pathway. The pathway consists of two metabolic phases, ... -
Deeper below the surface – transcriptional changes of selected Clostridium beijerinckii NRRL B-598 genes induced by butanol shock
Patáková, Petra; Kolek, Jan; Jurečková, Kateřina; Branská, Barbora; Sedlář, Karel; Vasylkivska, Maryna; Provazník, Ivo (John Wiley & Sons, 2020-12-14)The main bottleneck in the return of industrial butanol production from renewable feedstock, by acetone-butanol-ethanol (ABE) fermentation by clostridia, such as Clostridium beijerinckii, is the low final butanol concentration. ... -
Genová regulace v Clostridium beijerinckii NRRL B-598
Schwarzerová, JanaDiplomová práce se zabývá studiem genové regulace v Clostridium beijerinckii NRRL B-598, pro následné odvození genové regulační sítě bakterie C. beijerinckii NRRL B-598. V teoretické části této práce je uvedena obecná ... -
Hledání korelátů změn tepové frekvence v fMRI datech
Jurečková, KateřinaTato diplomová práce pojednává o problematice hledání korelátů změn tepové frekvence v datech funkční magnetické rezonance. Nejprve je popsán princip funkční magnetické rezonance, vznik BOLD signálu, akvizice dat, jejich ... -
Online databáze sekvenčních a melt typů bakterií
Františová, ZuzanaPředmětem této diplomové práce je vytvoření databáze známých sekvenčních a melt typů patogenních bakterií a nástroje pro správu databáze. Metoda popisovaná v této práci je poměrně nová technika typizace patogenních bakterií ... -
Phenotypic and genomic analysis of Clostridium beijerinckii NRRL B-598 mutants with increased butanol tolerance
Vasylkivska, Maryna; Branská, Barbora; Sedlář, Karel; Jurečková, Kateřina; Provazník, Ivo; Patáková, Petra (Frontiers, 2020-11-05)N-Butanol, a valuable solvent and potential fuel extender, can be produced via acetone-butanol-ethanol (ABE) fermentation. One of the main drawbacks of ABE fermentation is the high toxicity of butanol to producing cells, ... -
Software pro extrakci genomických dat z GenBank formátu
Jurečková, KateřinaTato bakalářská práce obsahuje literární rešerši na témata databáze GenBank, její nejpoužívanější datový formát gbk a jeho srovnání s dalšími používanými formáty sekvenčních dat. Dále práce popisuje strukturu mitochondriální ... -
Transcriptional analysis of amino acid, metal ion, vitamin and carbohydrate uptake in butanol-producing Clostridium beijerinckii NRRL B-598
Vasylkivska, Maryna; Jurečková, Kateřina; Branská, Barbora; Sedlář, Karel; Kolek, Jan; Provazník, Ivo; Patáková, Petra (PLOS, 2019-11-07)In-depth knowledge of cell metabolism and nutrient uptake mechanisms can lead to the development of a tool for improving acetone-butanol-ethanol (ABE) fermentation performance and help to overcome bottlenecks in the process, ... -
A transcriptional response of Clostridium beijerinckii NRRL B-598 to a butanol shock
Sedlář, Karel; Kolek, Jan; Gruber, Markus; Jurečková, Kateřina; Branská, Barbora; Csaba, Gergely; Vasylkivska, Maryna; Zimmer, Ralf; Patáková, Petra; Provazník, Ivo (BioMed Central, 2019-10-13)Background One of the main obstacles preventing solventogenic clostridia from achieving higher yields in biofuel production is the toxicity of produced solvents. Unfortunately, regulatory mechanisms responsible for the ...