Browsing by Subject "16S rRNA"
Now showing items 1-9 of 9
-
Bioinformatický nástroj pro klasifikaci bakterií do taxonomických kategorií na základě sekvence genu 16S rRNA
Tato práce se zabývá problematikou automatizované klasifikace a rozpoznávání bakterií po získání jejich DNA procesem sekvenování. V rámci této práce je navržena a popsána nová metoda klasifikace založená na základě segmentu ... -
Bioinformatický nástroj pro odhad abundance bakteriálních funkčních molekul v biologických vzorcích na základě metagenomických dat 16S rRNA
Ľudské telo je prostredím pre život neuveriteľného množstva mikróbov. Niektoré z nich môžu spôsobovať rôzne choroby, ale ďalšie, napríklad črevný mikrobióm, sú pre život a zdravie človeka nepostrádateľné. Nanešťastie, ... -
Bipartite Graphs for Visualization Analysis of Microbiome Data
(Libertas Academica, 2016-05-31)Visualization analysis plays an important role in metagenomics research. Proper and clear visualization can help researchers get their first insights into data and by selecting different features, also revealing and ... -
Characterization of antibiotic resistance gene abundance and microbiota composition in feces of organic and conventional pigs from four EU countries
(Plos, 2015-06-28)One of the recent trends in animal production is the re-appearance of organic farming. The interest of wide public in organic farming is affected by interest in animal welfare and lower use of antibiotics in organic than ... -
Characterization of Egg Laying Hen and Broiler Fecal Microbiota in Poultry Farms in Croatia, Czech Republic, Hungary and Slovenia
(Public Library of Science, 2014-10-16)Poultry meat is the most common protein source of animal origin for humans. However, intensive breeding of animals in confined spaces has led to poultry colonisation by microbiota with a zoonotic potential or encoding ... -
Klasifikace bakterií do taxonomických kategorií na základě vlastností 16s rRNA
Hlavným cieľom tejto práce bolo navrhnúť a implementovať nástroj, ktorý by bol schopný klasifikovať sekvencie génu 16S rRNA do taxonomických kategórií s využitím vlastností génu 16S rRNA. Vytvorený nástroj analyzuje všetky ... -
Klasifikace bakterií pomocí markerových genů
Cílem této práce je návrh a implementace nové metody klasifikace bakterií podle sekvencí několika markerových genů. Pro řešení tohoto problému bylo zvoleno 10 markerových genů. Výsledný MultiGene klasifikátor dělí trénovací ... -
Stool sampling and DNA isolation kits affect DNA quality and bacterial composition following 16S rRNA gene sequencing using MiSeq Illumina platform
(Springer Nature, 2019-09-25)Many studies correlate changes in human gut microbiome with the onset of various diseases, mostly by 16S rRNA gene sequencing. Setting up the optimal sampling and DNA isolation procedures is crucial for robustness and ... -
Succession and Replacement of Bacterial Populations in the Caecum of Egg Laying Hens over Their Whole Life
(Public Library of Science, 2014-12-12)In this study we characterised the development of caecal microbiota in egg laying hens over their commercial production lifespan, from the day of hatching until 60 weeks of age. Using pyrosequencing of V3/V4 variable regions ...