• čeština
    • English
    • русский
    • Deutsch
    • français
    • polski
    • українська
  • čeština 
    • čeština
    • English
    • русский
    • Deutsch
    • français
    • polski
    • українська
  • Login
View Item 
  •   Repository Home
  • Závěrečné práce
  • dizertační práce
  • Fakulta strojního inženýrství
  • 2019
  • View Item
  •   Repository Home
  • Závěrečné práce
  • dizertační práce
  • Fakulta strojního inženýrství
  • 2019
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Vývoj biofyzikální interpretace dat kvantitativního fázového zobrazování

Development of Biophysical Interpretation of Quantitative Phase Image Data

Thumbnail
View/Open
Posudek-Oponent prace-Ing. Petr Jakl Ph.D.pdf (71.25Kb)
Posudek-Oponent prace-Oponentsky posudek A.Krizova.pdf (596.8Kb)
Posudek-Vedouci prace-stanovisko skolitele.pdf (55.06Kb)
final-thesis.pdf (4.476Mb)
thesis-1.pdf (2.200Mb)
review_113796.html (1.741Kb)
Author
Křížová, Aneta
Advisor
Chmelík, Radim
Referee
Jákl, Petr
Vomastek, Tomáš
Grade
P
Altmetrics
Metadata
Show full item record
Abstract
Doktorská práce se zabývá biofyzikální interpretací dat kvantitativního fázového zobrazování (QPI – quantitative phase imaging) získaného pomocí koherencí řízeného holografického mikroskopu (CCHM – coherence-controlled holographic microscope). V práci jsou nejprve popsány metody vyhodnocující informace z QPI jako analýza tvarových a dynamických cha-rakteristik segmentovaných objektů a také vyhodnocování samotné fázové informace. Dále je navržena metoda dynamických fázových diferencí (DPD – dynamic phase differences), která umožňuje detailněji sledovat přesuny hmoty uvnitř buněk. Všechny uvedené metody jsou pak využity v biologických aplikacích. V rozsáhlé studii různých typů buněčných smrtí jsou informace z QPI porovnány s daty z průtokové cytometrie a s výhodou je využita kombinace QPI a fluorescenční mikroskopie. Metoda DPD je pak využita při studiu přesunů hmoty uvnitř buňky při osmotických jevech. Zjednodušená metoda DPD je aplikována při výzkumu mechanizmu pohybu nádorových buněk v kolagenových gelech.
 
This doctoral thesis deals with biophysical interpretation of quantitative phase imaging (QPI) gained with coherence-controlled holographic microscope (CCHM). In the first part methods evaluating information from QPI such as analysis of shape and dynamical characteristics of segmented objects as well as evaluation of the phase information itself are described. In addition, a method of dynamic phase differences (DPD) is designed to allow more detailed monitoring of cell mass translocations. All of these methods are used in biological applications. In an extensive study of various types of cell death, QPI information is compared with flow cytometry data, and preferably a combination of QPI and fluorescence microscopy is used. The DPD method is used to study mass translocations inside the cell during osmotic events. The simplified DPD method is applied to investigate the mechanism of tumor cell movement in collagen gels.
 
Keywords
Koherencí řízený holografický mikroskop, kvantitativní fázové zobrazování, dynamické fázové diference, buněčná smrt, osmotické jevy, zobrazování ve 3D prostředích, dynamika buněk, kolagenové gely, filtrace prostorových frekvencí., Coherence-controlled holographic microscope, quantitative phase imaging, dynamic phase differences, cell death, osmotic challenge, imaging in 3D environments, cell dynamics, collagen gels, spatial frequencies filtration.
Language
čeština (Czech)
Study brunch
Fyzikální a materiálové inženýrství
Composition of Committee
prof. RNDr. Petr Dub, CSc. (předseda) Ing. Petr Jákl, Ph.D. (člen) Ing. Tomáš Vomastek, Ph.D. (člen) prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Jiří Petráček, Dr. (člen)
Date of defence
2019-04-11
Process of defence
DDP významně přispívá k rozšíření možností aplikace koherencí řízeného holografického mikroskopu a obecněji také metod nekoherentního holografického kvantitativního fázového zobrazení (hiQPI) v biologii živé buňky tím, že navrhla a ověřila korektní postupy při pozorování buněk ve 2D i 3D prostředích a biofyzikální metody interpretace takto získávaných obrazových dat.
Result of the defence
práce byla úspěšně obhájena
Persistent identifier
http://hdl.handle.net/11012/176156
Source
KŘÍŽOVÁ, A. Vývoj biofyzikální interpretace dat kvantitativního fázového zobrazování [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. 2019.
Collections
  • 2019 [37]
Citace PRO

Portal of libraries | Central library on Facebook
DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback | Theme by @mire NV
 

 

Browse

All of repositoryCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

My Account

LoginRegister

Statistics

View Usage Statistics

Portal of libraries | Central library on Facebook
DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback | Theme by @mire NV