Implementace nástroje pro analýzu lokálních struktur DNA
Implementation of local DNA structures analysis tool
Author
Advisor
Šťastný, JiříReferee
Trenz, OldřichGrade
AAltmetrics
Metadata
Show full item recordAbstract
Tato diplomová práce je zaměřena na popis a realizaci aplikace API wrapper, která pracuje nad výpočetním jádrem ibp bioinformatics. První polovina práce se zaměřuje na shrnutí základních znalostí z oblasti výzkumu DNA, rovněž i specifikaci problému a popisu zvolených technologií. Druhá polovina se soustředí na samotnou realizaci, distribuci a vyhodnocení použitelnosti aplikace na konkrétních sekvencích DNA. This diploma thesis is focused on the description and implementation of the API wrapper application, which works on top of computational core ibp bioinformatics. The first half of the thesis is focused on the summary of basic knowledge in the field of DNA research, as well as the specification of the problem and description of selected technologies. The other half deals with the actual implementation, distribution, and evaluation of application applicability on specific DNA sequences.
Keywords
REST API, Python, Jupyter notebook, pypi, DNA, lokální struktury, guaninový kvadruplex, REST API, Python, Jupyter notebook, pypi, DNA, local structures, guanine quadruplexLanguage
čeština (Czech)Study brunch
Aplikovaná informatika a řízeníComposition of Committee
prof. Ing. Dagmar Janáčová, CSc. (předseda) doc. Ing. Jan Chyský, CSc. (místopředseda) prof. RNDr. Ing. Jiří Šťastný, CSc. (člen) prof. RNDr. Ing. Miloš Šeda, Ph.D. (člen) doc. RNDr. Jindřich Klapka, CSc. (člen)Date of defence
2019-06-19Process of defence
Student odprezentoval svou práci. Student odpověděl na otázky oponenta a dodatečné otázky komise.Result of the defence
práce byla úspěšně obhájenaPersistent identifier
http://hdl.handle.net/11012/179104Source
KAURA, P. Implementace nástroje pro analýzu lokálních struktur DNA [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. 2019.Collections
- 2019 [499]