Sledování migrace buněk v mikrofluidním systému metodou „Scratch Wound Healing Assay“
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
B
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Tato diplomová práce se zabývá popisem principů kultivace embryonálních fibroblastových buněk myší (3T3), lidských endoteliálních buněk odebraných z pupečníkové žily (HUVEC) a epiteliálních buněk vaječníku čínského křečka (CHO) v mikrofluidních systémech simulujících kapiláry. Byly provedeny literární rešerše v oblasti realizací experimentu “Scratch Wound Healing Assay” v mikrofluidních systémech s použitím fibroblastů a endotheliálních buněk. V práci jsou dále popsány principy konfokální a fluorescenční mikroskopie a metody zpracování obrazů pro sledování buněčné migrace. Experimentální nastavení pro mikrofluidní realizaci “Scratch Wound Healing Assay” s použitím trypsinu – EDTA pro vytvoření rýhy, a konfokálního mikroskopu Leica TCS SP8 X pro následující snímání pořízených dat bylo navrženo a otestováno s dostatečným počtem opakování. Vhodný algoritmus pro analýzu buněčné migrace byl napsán v programovacím prostředí Matlab. Závěrem této práce je diskuze získaných výsledků.
This thesis describes the cell culture methods of mouse embryonic fibroblast (3T3), human umbilical vein endothelial (HUVEC), and Chinese hamster ovary (CHO) cell lines in microfluidic systems simulating capillary. Literature research for microfluidic realizations of Scratch Wound Healing Assay with fibroblasts and endothelial cell lines was performed in this thesis. The principles of confocal and fluorescence microscopy, and relevant image processing techniques used for quantifying cell migration were studied. Experimental setup for microfluidic Scratch Wound Healing Assay with using of trypsin – EDTA for creation of cell delusion, and confocal microscope Leica TCS SP8 X for subsequent image acquisition was proposed and tested. An appropriate algorithm for cell migration analysis was written in Matlab computing environment. Experiment’s results are discussed in the conclusion of this thesis.
This thesis describes the cell culture methods of mouse embryonic fibroblast (3T3), human umbilical vein endothelial (HUVEC), and Chinese hamster ovary (CHO) cell lines in microfluidic systems simulating capillary. Literature research for microfluidic realizations of Scratch Wound Healing Assay with fibroblasts and endothelial cell lines was performed in this thesis. The principles of confocal and fluorescence microscopy, and relevant image processing techniques used for quantifying cell migration were studied. Experimental setup for microfluidic Scratch Wound Healing Assay with using of trypsin – EDTA for creation of cell delusion, and confocal microscope Leica TCS SP8 X for subsequent image acquisition was proposed and tested. An appropriate algorithm for cell migration analysis was written in Matlab computing environment. Experiment’s results are discussed in the conclusion of this thesis.
Description
Citation
MORGAENKO, K. Sledování migrace buněk v mikrofluidním systému metodou „Scratch Wound Healing Assay“ [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2019.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
en
Study field
Biomedicínské a ekologické inženýrství
Comittee
prof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D. (předseda)
Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (místopředseda)
Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (člen)
Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (člen)
MUDr. Marie Nováková, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2019-08-28
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky.
Ing. Jakubíček položil otázku na segmentaci obrazu, která byla v práci použita.
Studentka obhájila diplomovou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení