Odhad entropie a komprese biologických sekvencí
Entropy rate estimation and compression of biological sequences
Author
Advisor
Škutková, HelenaReferee
Kozumplík, JiříGrade
CAltmetrics
Metadata
Show full item recordAbstract
Táto diplomová práca popisuje poznatky o biologických sekvenciách, princípy odhadu entropie a možnosti kompresie DNA sekvencií pomocou substitučných metód. Text obsahuje praktickú časť, kde sú využité kompresné algoritmy a praktický odhad entropie. This master thesis describes theoretical knowledge of biological sequences, principles entropy rate estimates and possibilities of compression of DNA sequences using the substitution methods. Thesis includes practical application of the compression algorithm and practical estimation of entropy.
Keywords
entropia, kompresia, biologické sekvencie, DNA, matlab, fasta, entropy, compression, biological sequences, DNA, matlab, fastaLanguage
čeština (Czech)Study brunch
Biomedicínské a ekologické inženýrstvíComposition of Committee
doc. Ing. Aleš Drastich, CSc. (předseda) doc. Ing. Jiří Kozumplík, CSc. (místopředseda) prof. MUDr. Jindřich Vomela, CSc. (člen) Ing. Milan Blaha, Ph.D. (člen) Ing. Josef Halámek, CSc. (člen)Date of defence
2013-06-10Process of defence
Student obhájil diplomovou práci s výhradami.Result of the defence
práce byla úspěšně obhájenaPersistent identifier
http://hdl.handle.net/11012/27064Source
MIŠČÍK, P. Odhad entropie a komprese biologických sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.Collections
- 2013 [428]