Odhad entropie a komprese biologických sekvencí

Miščík, Peter

Entropy rate estimation and compression of biological sequences

Grade

Altmetrics

Metadata

Show full item record

Abstract

Táto diplomová práca popisuje poznatky o biologických sekvenciách, princípy odhadu entropie a možnosti kompresie DNA sekvencií pomocou substitučných metód. Text obsahuje praktickú časť, kde sú využité kompresné algoritmy a praktický odhad entropie.

This master thesis describes theoretical knowledge of biological sequences, principles entropy rate estimates and possibilities of compression of DNA sequences using the substitution methods. Thesis includes practical application of the compression algorithm and practical estimation of entropy.

Keywords

entropia, kompresia, biologické sekvencie, DNA, matlab, fasta, entropy, compression, biological sequences, DNA, matlab, fasta

Language

čeština (Czech)

Study brunch

Biomedicínské a ekologické inženýrství

Composition of Committee

doc. Ing. Aleš Drastich, CSc. (předseda) doc. Ing. Jiří Kozumplík, CSc. (místopředseda) prof. MUDr. Jindřich Vomela, CSc. (člen) Ing. Milan Blaha, Ph.D. (člen) Ing. Josef Halámek, CSc. (člen)

Date of defence

2013-06-10

Process of defence

Student obhájil diplomovou práci s výhradami.

Result of the defence

práce byla úspěšně obhájena

Persistent identifier

http://hdl.handle.net/11012/27064

Source

MIŠČÍK, P. Odhad entropie a komprese biologických sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.

Collections

2013 [428]