Show simple item record

Detection of Related Proteins with Modified Function

dc.contributor.advisorMartínek, Tomášcs
dc.contributor.authorHon, Jiřícs
dc.date.accessioned2018-10-21T20:57:40Z
dc.date.available2018-10-21T20:57:40Z
dc.date.created2015cs
dc.identifier.citationHON, J. Vyhledávání příbuzných proteinů s modifikovanou funkcí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2015.cs
dc.identifier.other88627cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/52238
dc.description.abstractProteinové inženýrství je dynamicky se rozvíjecí obor s velkým množstvím potenciálních aplikací v praxi. Úspěch v tomto oboru je však podmíněn co nejlepším využitím všech dostupných informací o proteinech, k čemuž se využívá množství bioinformatických nástrojů a analýz. Cílem této práce je vytvoření nového nástroje na podporu proteinového inženýrství, který by umožnil vyhledávání příbuzných proteinů s modifikovanou funkcí ve stále rostoucích proteinových databázích. Návrh tohoto nástroje je koncipován jako spojení řady existujících bioinformatických analýz a umožní identifikovat příbuzné proteiny se stejným typem enzymatické funkce, avšak s mírně modifikovanými vlastnostmi, především z hlediska selektivity, reakční rychlosti a stability.cs
dc.description.abstractProtein engineering is a young dynamic discipline with great amount of potential practical applications. However, its success is primarily based on perfect knowledge and usage of all existing information about protein function and structure. To achieve that, protein engineering is supported by plenty of bioinformatic tools and analysis. The goal of this project is to create a new tool for protein engineering that would enable researchers to identificate related proteins with modified function in still growing biological databases. The tool is designed as an automated workflow of existing bioinformatic analyses that leads to identification of proteins with the same type of enzymatic function, but with slightly modified properties - primarily in terms of selectivity, reaction speed and stability.en
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectvyhledávání příbuzných proteinůcs
dc.subjectpredikce funkce proteinucs
dc.subjectbioinformatikacs
dc.subjectrelated protein identificationen
dc.subjectprotein function predictionen
dc.subjectbioinformaticsen
dc.titleVyhledávání příbuzných proteinů s modifikovanou funkcícs
dc.title.alternativeDetection of Related Proteins with Modified Functionen
dc.typeTextcs
dcterms.dateAccepted2015-06-22cs
dcterms.modified2020-05-10-16:12:02cs
thesis.disciplineBioinformatika a biocomputingcs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémůcs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
sync.item.dbid88627en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.10 14:16:28en
sync.item.modts2021.11.10 13:31:47en
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
dc.contributor.refereeBendl, Jaroslavcs
dc.description.markAcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
but.committeeprof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. RNDr. Alexandr Meduna, CSc. (místopředseda) Ing. Vladimír Bartík, Ph.D. (člen) Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) Ing. William Steingartner, Ph.D. (člen) doc. Ing. František Zbořil, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm " A ". Otázky u obhajoby: Na základě jakých parametrů byly vybrány nástroje integrované do jednotlivých kroků algoritmu (Caver pro vyhledání tunelů, CASTp pro detekci kapes atd.)? Nakolik je současná platforma připravena pracovat s jinými rodinami enzymů než jsou haloalkan dehalogenázy? Dovedete odhadnout, nakolik je příprava vstupních dat pro uživatele náročná?cs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
but.programInformační technologiecs
but.jazykčeština (Czech)


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record