Analýza dat z mikročipů pro zjišťování genové exprese
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
C
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstract
Práce se zabývá analýzou dat z DNA mikročipů pomocí shlukové analýzy. Vysvětluje biologické pojmy - genová exprese a DNA mikročip. Následně obsahuje matematický a informatický popis metod shlukování a popisuje, jak tyto metody aplikovat na data z mikročipů. Dále práce obsahuje implementační detaily shlukovacích metod k-means, DBSCAN a představuje originální shlukovací algoritmus Strom++. Poté následuje popis implementace a ovládání programu. Na konec jsou zhodnoceny dosažené výsledky.
This work concerns with data analysis of DNA microarrays by using cluster analysis. It explains biological terms - gene expression and DNA microarray. Next, it contains mathematical and informatical description of clustering methods and describes a way to apply these methods to microarrays data. Next, the work contains implementation's detail of clustering methods k-means, DBSCAN and introduces an original clustering algorithm Strom++. Then, description of implementation and application manual follow. Finally, accomplished results are evaluated.
This work concerns with data analysis of DNA microarrays by using cluster analysis. It explains biological terms - gene expression and DNA microarray. Next, it contains mathematical and informatical description of clustering methods and describes a way to apply these methods to microarrays data. Next, the work contains implementation's detail of clustering methods k-means, DBSCAN and introduces an original clustering algorithm Strom++. Then, description of implementation and application manual follow. Finally, accomplished results are evaluated.
Description
Citation
HEBELKA, T. Analýza dat z mikročipů pro zjišťování genové exprese [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2010.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Informační systémy
Comittee
doc. Dr. Ing. Dušan Kolář (předseda)
prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (místopředseda)
doc. Ing. Přemysl Kršek, Ph.D. (člen)
Ing. Ivana Burgetová, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Jiří Rybička, Dr. (člen)
RNDr. Marek Rychlý, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2010-06-21
Defence
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm C. Otázky u obhajoby: Proč se pro testování nepoužívala reálná data, ale místo nich byla generována umělá? Práce je psaná v 1. osobě množného čísla. V kapitole 9 to ale může být trochu matoucí, když píšete: "Zkoušeli jsme testovat ...", "Zkusili jsme spouštět ..." apod. Pracoval jste na práci sám?
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení