Detekce genů v DNA sekvencích

Gene Detection in DNA Sequences

Thumbnail
View/Open
Author
Advisor
Martínek, Tomáš
Referee
Burgetová, Ivana
Grade
C
Altmetrics
Metadata
Show full item record
Abstract
Tato práce se věnuje problematice detekce genů v DNA sekvencích. Vysvětluje spůsob uložení informace v DNA sekvencích, poskytuje přehled některých metod pro detekci genů, konkrétně popisuje vybrané metody a výsledky testů těchto metod na reálnych datech (geném bakterie E. coli K12). Obsahuje porovnání efektivity metod při různých parametrech a efektivity metod mezi sebou.
 
This work is about gene detection in DNA sequencies. It explains how the information in DNA is stored, shows preview of various gene prediction methods, describes picked methods and results of testing those methods on real data (genome of bacteria E. Coli K12), compares efficiency of methods with various paramaters and efficiency between methods.
 
Keywords
molekulární biologie, DNA, detekce genů, génová predikce, prokaryoty, molecular biology, DNA, gene detection, gene prediction, prokaryotes
Language
čeština (Czech)
Study brunch
Informační technologie
Composition of Committee
prof. Ing. Jan M. Honzík, CSc. (předseda) doc. Ing. Jiří Kunovský, CSc. (místopředseda) Ing. Martin Hrubý, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Kořenek, Ph.D. (člen) Mgr. Ing. Pavel Očenášek, Ph.D. (člen)
Date of defence
2011-06-15
Process of defence
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm dobře (C). Otázky u obhajoby: Jaká data jste použil k určení hodnot v tabulkách 13 a 15? Proč jste nezkombinoval statistické metody s jinými metodami? Tyto metody jsou totiž velmi často využívány ve spojení s jinými metodami, aby zlepšili jejich přesnost.
Result of the defence
práce byla úspěšně obhájena
Persistent identifier
http://hdl.handle.net/11012/55805
Source
BAHUREK, T. Detekce genů v DNA sekvencích [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2011.
Collections
Citace PRO