• čeština
    • English
    • русский
  • English 
    • čeština
    • English
    • русский
  • Login
View Item 
  •   Repository Home
  • Závěrečné práce
  • diplomové práce
  • Fakulta informačních technologií
  • 2016
  • View Item
  •   Repository Home
  • Závěrečné práce
  • diplomové práce
  • Fakulta informačních technologií
  • 2016
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Akcelerace algoritmů Lattice-Boltzmann pro modelování toku krve v mozku

Acceleration of Lattice-Boltzmann Algorithms for Bloodflow Modeling

Thumbnail
View/Open
final-thesis.pdf (1.471Mb)
Posudek-Oponent prace-18589_o.pdf (124.4Kb)
Posudek-Vedouci prace-18589_v.pdf (86.46Kb)
review_96443.html (1.467Kb)
Author
Kompová, Radmila
Advisor
Jaroš, Jiří
Referee
Kešner, Filip
Grade
A
Altmetrics
Metadata
Show full item record
Abstract
Tato práce se zabývá implementací a možnými optimalizacemi metody lattice-Boltzmann. Tato metoda umožňuje modelovat tok kapalin pomocí simulace pohybu fiktivních částic. Práce se zaměřuje na možná vylepšení existujícícho nástroje HemeLB, který se specializuje na simulaci proudění krve v mozku. V práci jsou mimo jiné zkoumány techniky vektorizace a paralelizace jejichž implementace by mohla pro tento nástroj být přínosná. Součástí práce je implementace aplikace srovnávající několik vybraných algoritmů pro metodu lattice-Boltzmann včetně jejich možných optimalizací. Zahrnuty jsou rovněž testy zaměřené na srovnání těchto algoritmů dle dosaženého výkonu, využití paměti cache a celkové spotřeby paměti. Nejlepší dosažený výkon byl 150 milionů aktualizovaných bodů mřížky za sekundu.
 
This thesis aims to explore possible implementations and optimizations of the lattice-Boltzmann method. This method allows modeling of fluid flow using a simulation of fictive particles. The thesis focuses on possible improvements of the existing tool HemeLB which  is designed and optimized for bloodflow modeling. Several vectorization and paralellization approaches that could be included in this tool are explored. An application focused on comparing chosen algorithms including optimizations for the lattice-Boltzmann method was implemented as a part of the thesis. A group of tests focused on comparing this algorithms according to performance, cache usage and overall memory usage was performed. The best performance achieved was 150 millions of lattice site updates per second.
 
Keywords
Lattice-Boltzmann metoda, modelování toku krve, HemeLB, akcelerace algoritmů, vektorizace, paralelizace, OpenMP, Lattice-Boltzmann method, bloodflow modeling, HemeLB, algorithm acceleration, vectorization, parallelization, OpenMP
Language
čeština (Czech)
Study brunch
Bioinformatika a biocomputing
Composition of Committee
prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) doc. Ing. František Zbořil, Ph.D. (místopředseda) doc. Ing. Vladimír Janoušek, Ph.D. (člen) Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Platoš, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jaroslav Zendulka, CSc. (člen)
Date of defence
2016-06-20
Process of defence
Studentka nejprve prezentovala výsledky, kterých dosáhla v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Studentka následně odpověděla na otázku oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studentky na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm " A ". Otázky u obhajoby: Bude možné očekávat začlenění provedené implementace do programu HemoLB, například ve formě přispění do vývojového repozitáře?
Result of the defence
práce byla úspěšně obhájena
Persistent identifier
http://hdl.handle.net/11012/61824
Source
KOMPOVÁ, R. Akcelerace algoritmů Lattice-Boltzmann pro modelování toku krve v mozku [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2016.
Collections
  • 2016 [190]
Citace PRO

Portal of libraries | Central library on Facebook
DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback | Theme by @mire NV
 

 

Browse

All of repositoryCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

My Account

LoginRegister

Statistics

View Usage Statistics

Portal of libraries | Central library on Facebook
DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback | Theme by @mire NV