Detekce a identifikace typu obratle v CT datech onkologických pacientů
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
B
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Automaticka detekce a segmentace patere nebo obratlu z CT snimku je narocnym ukolem z nekolika duvodu. Jednim z duvodu jsou nejasne hranice obratlu ve snimcich a nezretelne hranice mezi jednotlivymi obratli, dale artefakty, vyskytujici se v obrazech, ale take anatomicka slozitost. Tato prace se zabyva navrhem a realizaci detekce a klasifikace typu obratle v CT snimcich onkologickych pacientu, coz pridava na slozitosti z duvodu pritomnosti deformaci nekterych obratlu. Pri samotne segmentaci obratlu je vyuzita Otsuova metoda. Detekce obratlu je zalozena na hledani hranic oddelujici jednotlive obratle vsagitalnich rezech. Pro identifikaci potom slouzi rozhodovaci stromy nebo zobecnena Houghova, pricemz jsou obratle hledany v rezech CT snimku na zaklade podobnosti tvaru s modely jednotlivych obratlu.
Automated spine or vertebra detection and segmentation from CT images is a difficult task for several reasons. One of the reasons is unclear vertebra boundaries and indistinct boundaries between vertebra. Next reason is artifacts in images and high degree of anatomical complexity. This paper describes the design and implementation of vertebra detection and classification in CT images of cancer patients, which adds to the complexity because some of vertebrae are deformed. For the vertebra segmentation, the Otsu’s method is used. Vertebra detection is based on search of borders between individual vertebra in sagittal planes. Decision trees or the generalized Hough transform is applied for the identification whereas the vertebra searching is based on similarity between each vertebra model shape and planes of CT scans.
Automated spine or vertebra detection and segmentation from CT images is a difficult task for several reasons. One of the reasons is unclear vertebra boundaries and indistinct boundaries between vertebra. Next reason is artifacts in images and high degree of anatomical complexity. This paper describes the design and implementation of vertebra detection and classification in CT images of cancer patients, which adds to the complexity because some of vertebrae are deformed. For the vertebra segmentation, the Otsu’s method is used. Vertebra detection is based on search of borders between individual vertebra in sagittal planes. Decision trees or the generalized Hough transform is applied for the identification whereas the vertebra searching is based on similarity between each vertebra model shape and planes of CT scans.
Description
Keywords
Detekce obratle, klasifikace typu obratle, pocitacova tomografie (CT), pater, obratel, segmentace obrazu, zobecnena Houghova transformace, rozhodovaci stromy, Vertebra detection, vertebra classification, computed tomography (CT), spine, vertebra, image segmentation, generalized Hough transform, decision trees
Citation
VĚŽNÍKOVÁ, R. Detekce a identifikace typu obratle v CT datech onkologických pacientů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2017.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínské inženýrství a bioinformatika
Comittee
doc. Ing. Jiří Kozumplík, CSc. (předseda)
doc. RNDr. Jaromír Baštinec, CSc. (místopředseda)
doc. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. (člen)
Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen)
Ing. Helena Škutková, Ph.D. (člen)
Ing. Roman Jakubíček, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2017-06-06
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky.
Doc. Baštinec: Mluvíte o průměrné kvadratické odchylce ale vzorec se týká průměru. Pracujete s nejmenší směrodatnou odchylkou, jak ji vyberete? Pracujete s 19 snímky, není to málo?
Doc. Kozumplík: Mluvíte o pixelu, co se tímto pojmem myslí?
Ing. Škutková: Na základě čeho jste zjišťovala úhly čar na obrázku?
Studentka obhájila magisterskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení