Segmentace buněk ve snímcích z vysokorychlostní digitální kamery
Segmentation of cells in images from high-speed digital camera
Author
Advisor
Odstrčilík, JanReferee
Čmiel, VratislavGrade
BAltmetrics
Metadata
Show full item recordAbstract
V první části se práce zabývá mikroskopickými metodami snímání srdečních buněk. V druhé části jsou popsány segmentační techniky zpracování obrazu. Praktická část je zaměřena na segmentaci buněk z šesti dostupných záznamů. Výsledky jednotlivých segmentačních metod jsou zobrazeny a okomentovány. V poslední části jsou vytvořeny kontrakční křivky buňky v jednotlivých videozáznamech, které jsou zhodnoceny. The first part of this thesis is dealing with topic of microscopic techniques focusing on monitoring of cardiomyocytes. Techniques used for image segmentation are described in the second part. The practical part is about image segmentation of six records. The results are presented and discussed. The contraction functions are described in the final part.
Keywords
Mikroskopie, kardiomyocyt, zpracování obrazu, segmentace obrazu, kontrakce kardiomyocytu, analýza kontraktility, Microscopy, cardiomyocyte, image processing, image segmentation, cardiomyocyte contraction, contractility analysisLanguage
čeština (Czech)Study brunch
Biomedicínská technika a bioinformatikaComposition of Committee
doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Martin Rožánek, Ph.D. (místopředseda) Ing. Marina Ronzhina, Ph.D. (člen) Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D. (člen) MUDr. Michal Jurajda, Ph.D. (člen) doc. MUDr. Iva Slaninová, Ph.D. (člen)Date of defence
2019-06-12Process of defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Doc. Rožánek položil otázku: Jaké jsou vzdálenosti mezi buňkami? Filtrovala jste vstupní data? Doc. Slaninová položila otázku: Co znamená obsah buňky? Jak by dal tento parametr využít? Doc. Kolář položil otázku: Jaká data byla použita a jak byla získána? Ing. Ronzhina položila otázku: Jak by se dal odstranit "tmavý flek" v obrázku bunka3? MUDr. Jurajda položil otázku: Předzpracovávala jste vstupní videa? Který frame rate je pro Váš algoritmus optimální? Je šum ovlivněný frame ratem? Studentka obhájila bakalářskou práci.Result of the defence
práce byla úspěšně obhájenaPersistent identifier
http://hdl.handle.net/11012/173638Source
BOUDOVÁ, M. Segmentace buněk ve snímcích z vysokorychlostní digitální kamery [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2019.Collections
- 2019 [379]