• čeština
    • English
    • русский
  • English 
    • čeština
    • English
    • русский
  • Login
View Item 
  •   Repository Home
  • Závěrečné práce
  • bakalářské práce
  • Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
  • 2020
  • View Item
  •   Repository Home
  • Závěrečné práce
  • bakalářské práce
  • Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
  • 2020
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Bioinformatická analýza jednonukleotidových polymorfismů v databázi 1000 Genomes Project

Bioinformatic analysis of single nucleotide polymorphisms in the 1000 Genomes Project database

Thumbnail
View/Open
appendix-1.zip (3.190Mb)
final-thesis.pdf (2.576Mb)
review_126718.html (8.101Kb)
Author
Parobková, Viktória
Advisor
Provazník, Ivo
Referee
Roy, Sudeep
Grade
A
Altmetrics
Metadata
Show full item record
Abstract
Sekvenovanie celého ľudského genómu a nájdenie jeho variácii bolo výzvou počas mnohých rokov. Znalosť všetkých genetických variácií je pozoruhodne prospešná pri výskume chorôb. Táto práca je zameraná na genetické variácie človeka a ich dva hlavné výskumné projekty, The HapMap Project a The 1000 Genomes Project, ktoré pomohli v analýze chorôb. Prvá časť práce je venovaná teoretickému popisu projektov. V nasledujúcej časti práce sú popísané štruktúry databáz u oboch projektov a taktiež je predstavený online nástroj umožňujúci prehľadávanie a sťahovanie ich dát. Následne je prevedená štatistická, populačná a bioinformatická analýza štrukturálnych variácií produkovaných 3 fázou 1000 Genomes projektu.
 
The whole-Genome sequencing and its variations discovery were challenging for many years. The knowledge of all genetic variations is remarkably beneficial in disease research. The bachelor thesis is dedicated to human genetic variations and its two main research projects, the HapMap Project and the 1000 Genomes Project which notably helped the disease analyses. The first part describes both Projects and the following part explains the structure of their databases and presents software which enables to browse and download data from these projects. At last, statistical, population and bioinformatic analyses are performed on structural variant dataset assembled by the 1000 Genomes Project.
 
Keywords
DNA variácie, polymorfizmus, haplotyp, HapMap Project, 1000 Genomes Project, genotypovanie, sekvenovanie, VCF, gén, DNA variations, polymorphism, haplotype, HapMap Project, 1000 Genomes Project, genotyping, sequencing, VCF, gene
Language
angličtina (English)
Study brunch
Biomedicínská technika a bioinformatika
Composition of Committee
prof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Martin Černý, Ph.D. (místopředseda) Ing. Radovan Jiřík, Ph.D. (člen) Ing. Oto Janoušek, Ph.D. (člen) Mgr. Erik Staffa, Ph.D. (člen) MUDr. Jaromír Gumulec, Ph.D. (člen)
Date of defence
2020-06-23
Process of defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Jiřík položil otázku: Byla celá analýza provedena v R? Jaký je rozdíl v databázích a proč? MUDr. Gumulec položil otázku: Jak lze Vaše výsledky dále využít? Co by znamenalo rozdělení clusteru (u PCA) na dvě skupiny? Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of the defence
práce byla úspěšně obhájena
Persistent identifier
http://hdl.handle.net/11012/190315
Source
PAROBKOVÁ, V. Bioinformatická analýza jednonukleotidových polymorfismů v databázi 1000 Genomes Project [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2020.
Collections
  • 2020 [427]
Citace PRO

Related items

Showing items related by title, author, creator and subject.

  • Řízení projektu výstavby 

    Hašek, Jiří
    Bakalářská práce se věnuje problematice řízení projektu výstavby a vysvětluje základní pojmy, které se této oblasti týkají. Úkolem této práce je seznámení se základními metodami řízení projektu výstavby a jejich aplikace ...
  • Softwarová podpora plánování projektů 

    Netolický, Petr
    Tato bakalářská práce se zabývá projektovým managementem a porovnává programy, které jsou určeny na řízení investičního projektu. Tyto softwary slouží k plánování, správě úkolů, zdrojů a zjišťování aktuálního stavu projektu. ...
  • Softwarová podpora plánování projektů 

    Škorpík, Vojtěch
    Bakalářská práce se zabývá softwarovou podporou v plánování projektů a vysvětluje základní pojmy týkající se této oblasti. V praktické části jsou řešeny časové plány ve specializovaných programech na příkladu rekonstrukce ...

Portal of libraries | Central library on Facebook
DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback | Theme by @mire NV
 

 

Browse

All of repositoryCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

My Account

LoginRegister

Statistics

View Usage Statistics

Portal of libraries | Central library on Facebook
DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback | Theme by @mire NV