Show simple item record

Graphical representation of DNA and protein sequences

dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorPražák, Ondřejcs
dc.date.accessioned2018-10-21T16:55:30Z
dc.date.available2018-10-21T16:55:30Z
dc.date.created2011cs
dc.identifier.citationPRAŽÁK, O. Grafická reprezentace genomických a proteomických sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2011.cs
dc.identifier.other34222cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/30
dc.description.abstractÚprava sekvencí DNA a jejich vhodné zobrazení je důležitou součástí analýzy, porovnání a dalšího zpracování. Úkolem této práce je seznámení s vlastnostmi genomických a proteomických sekvencí a nalezení metod pro jejich zobrazení. Z důvodu velkého množství postupů a jejich dělení, je v této práci uvedeno pouze několik zástupců. Všechny metody popsané v textu jsou dle zadání naprogramovány v prostředí Matlab. Pomocí krátkých sekvencí DNA několika živočichů jsou vyzkoušeny a porovnány s originálním výzkumem. Některé metody obsahují, vedle grafického zobrazení, i příklad dalšího zpracování, převážně podobnostní analýza. Závěrem práce je porovnání výsledků analýzy a vybrat nejvhodnější metodu.cs
dc.description.abstractModification of DNA sequences and their suitable representation is important part of analysis, comparison and another processing. Goal of this paper is finding of suitable methods for representation of genomic and proteomic sequences. Because there is great number of metods, this paper will introduce only some of them. All selected methods, are described in the first part of this paper and they were programed in Matlab. Selected methods are illustrated on coding sequences of the first exon of the b-globin gene of 11 different species. Results are compared withresults from the original papers. Some methods are capable of another processing like cluster analysis. Output of this paper is comparison of results, gained from different methods, and finding the most suitable one.en
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNA sekvencecs
dc.subjectgrafická reprezentacecs
dc.subjectnumerická reprezentacecs
dc.subjectpodobnostcs
dc.subjectJukes-Cantorcs
dc.subjectNeedleman Wunschcs
dc.subjectzarovnánícs
dc.subjectDNA sequenceen
dc.subjectgraphical representationen
dc.subjectnumerical representationen
dc.subjectsimilarityen
dc.subjectJukes-Cantoren
dc.subjectNeedleman Wunschen
dc.subjectalignmenten
dc.titleGrafická reprezentace genomických a proteomických sekvencícs
dc.title.alternativeGraphical representation of DNA and protein sequencesen
dc.typeTextcs
dcterms.dateAccepted2011-06-08cs
dcterms.modified2011-06-14-14:56:10cs
thesis.disciplineBiomedicínské a ekologické inženýrstvícs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
sync.item.dbid34222en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2020.03.31 10:59:07en
sync.item.modts2020.03.31 09:32:21en
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.contributor.refereeKolářová, Janacs
dc.description.markDcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
but.committeeprof. Ing. Jiří Jan, CSc. (předseda) prof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D. (místopředseda) prof. MUDr.Ing. Petr Hluštík, Ph.D. (člen) Dr. Ing. Vlastimil Vondra (člen) Ing. Zenon Starčuk, CSc. (člen) MUDr. Lenka Forýtková, CSc. (člen)cs
but.defenceNa otázku oponenta diplomové práce doc. Kolářové (Je možné degradaci kvantifikovat?) student dostatečně odpověděl. V následující diskuzi byly studentovi kladeny otázky ohledně použitých metod, které student uspokojivě odpověděl.cs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
but.programElektrotechnika, elektronika, komunikační a řídicí technikacs
but.jazykčeština (Czech)


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record