Show simple item record

Prediction of the Effect of Amino Acid Substitutions on the Secondary Structure of Proteins

dc.contributor.advisorBendl, Jaroslavcs
dc.contributor.authorKadlec, Miroslavcs
dc.date.accessioned2018-10-21T17:24:06Z
dc.date.available2018-10-21T17:24:06Z
dc.date.created2013cs
dc.identifier.citationKADLEC, M. Predikce vlivu aminokyselinových mutací na sekundární strukturu proteinů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2013.cs
dc.identifier.other79528cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/52853
dc.description.abstractTato práce se zabývá aminokyselinovými mutacemi a jejich vlivem na sekundární strukturu proteinů. Hlavním cílem je dokázat hypotézu, že ačkoliv během evoluce dochází poměrně často ke změnám v primární struktuře bílkovin, sekundární struktura je vůči nim do jisté míry odolná. Elementy sekundární struktury pak zůstávájí téměř nezměněny i po provedení relativně velkého počtu mutací. Tato hypotéza byla ověřována prostřednictvím vy tvořeného simulátoru evoluce, který pracuje s libovolnou substituční maticí a integruje dva existující predikční nástroje: PSIPRED pro předpovídání sekundární struktury a PhD-SNP pro předpovídání škodlivosti konkrétních aminokyselinových mutací. Výsledky simulačních experimentů jsou graficky znázorněny a je diskutován jejich význam v souvislosti s výše zmíněnou hypotézu.cs
dc.description.abstractThis thesis is focused on amino acid substitutions and their impact on protein secondary structure. The main aim is to prove, that although the protein sequence is frequently mutated during the evolution, protein secondary structure is more robust against changes. In this case, the elements of protein secondary structure stay almost unchanged although a significant number of substitutions is observed. The proof of this hypothesis was obtained by developed simulator of evolution which employs two well-estabilished predicting tools: PSIPRED for prediction of protein secondary structure and PhD-SNP for prediction of the effect of amino acid substitution on protein function. The results of the experiments are provided as graphs and their meainings is discussed.en
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectSekundární struktura proteinůcs
dc.subjectaminokyselinové mutacecs
dc.subjectaminokyselinové substitucecs
dc.subjectproteinové predikce.cs
dc.subjectProtein secondary structureen
dc.subjectamino acid mutationsen
dc.subjectamino acid substitutionsen
dc.subjectprotein predictions.en
dc.titlePredikce vlivu aminokyselinových mutací na sekundární strukturu proteinůcs
dc.title.alternativePrediction of the Effect of Amino Acid Substitutions on the Secondary Structure of Proteinsen
dc.typeTextcs
dcterms.dateAccepted2013-06-13cs
dcterms.modified2020-05-10-16:11:21cs
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
sync.item.dbid79528en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2020.06.23 09:02:36en
sync.item.modts2020.06.23 08:24:31en
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
dc.contributor.refereeVogel, Ivancs
dc.description.markAcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
but.committeeprof. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Vladimír Drábek, CSc. (místopředseda) Ing. Radek Burget, Ph.D. (člen) Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) Ing. Petr Schwarz, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A . Otázky u obhajoby: V čom sa líši Váš experiment od experimentu publikovaného v časopise Bioinformatics? V časti 2.2.2 píšete: Kvartérní strukturu lze sledovat jen u některých složitejších proteinů, např. u DNA nebo fibrilárního kolagenu." Stručne vysvetlite, ako súvisí kvartérna štruktúra proteínu a DNA.cs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
but.programInformační technologiecs
but.jazykčeština (Czech)


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record