Aplikace pro zpracování dat z oblasti genového inženýrství

Abstract

Tato práce má několik cílů. Jedním z nich je seznámit s problematikou genového inženýrství, zejména pak s fragmentací DNA, makromolekulou DNA, metodami pro purifikaci a separaci nukleových kyselin, enzymy používanými k úpravám těchto kyselin, amplifikací a také seznámit se shlukovou a gradientovou analýzou. Dalším cílem je pak prostudovat existující nástroj a srovnat ho s návrhem vlastní aplikace, což si klade jako cíl třetí. S návrhem úzce souvisí poslední z cílů. Je jím samotná implementace a zápis, jak byla aplikace otestována s reálnými daty. Získané výsledky budou diskutovány, stejně jako možnosti dalšího rozšíření.

This masters thesis has a few objectives. One of them is to acquaint with the problems of genome engineering, especially with fragmentation of DNA, the macromolecule DNA, the methods for purification and separation of the nucleic acids, the enzymes used for modification of these acids, amplification and get to know with cluster and gradient analysis as well. The next aim is to peruse the existed application and compare it to the layout of the proposed application, that is the third aim. The last one from the objectives is the implementation and the report how was the application tested by the real data. The results will be discussed as well as the possibilities of the further extension.