• čeština
    • English
  • English 
    • čeština
    • English
  • Login
View Item 
  •   Repository Home
  • Závěrečné práce
  • diplomové práce
  • Fakulta informačních technologií
  • 2012
  • View Item
  •   Repository Home
  • Závěrečné práce
  • diplomové práce
  • Fakulta informačních technologií
  • 2012
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Vyhledávání přibližných palindromů v DNA sekvencích

Approximate Palindrome Detection in DNA Sequences

Thumbnail
View/Open
final-thesis.pdf (1.276Mb)
review_78538.html (1.452Kb)
Author
Divila, Jaroslav
Advisor
Martínek, Tomáš
Referee
Lexa, Matej
Grade
D
Alternative metrics PlumX
http://hdl.handle.net/11012/53667
Altmetrics
http://hdl.handle.net/11012/53667
http://hdl.handle.net/11012/53667
Metadata
Show full item record
Abstract
Tato práce se zabývá návrhem a implementací nástroje pro vyhledávání přibližných palindromů v sekvencích DNA. Zaměřuje se na popis DNA struktury, významu palindromů v DNA sekvencích a na popis metod pro vyhledávání přibližných palindromů. Hlavní část práce je zaměřena na návrh a popis implementace nástroje pro vyhledávání přibližných palindromů.
 
This work deals with conception and implemetation of tools for finding approximate palindromes in DNA sequences. The work focuses on the description of DNA structure, and on the function of palindromes in DNA sequences, and on the description of methods for finding approximate palindromes. Main part of thesis is focused on conclusion and description of implementation approximate palidromes finding tool.
 
Keywords
DNA, přibližné palindromy, vyhledávání palindromů, vyhledávání palindromů se smyčkou, sufixové stromy, sufixová pole, dynamické programování, vlásenky, křížové struktury, DNA, approximate palindromes, palidrome detection, stem-loop detection, suffix tree, suffix array, dynamics programming, hairpin, cruciform
Language
čeština (Czech)
Study brunch
Bioinformatika a biocomputing
Composition of Committee
prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. RNDr. Alexandr Meduna, CSc. (místopředseda) Ing. Vladimír Bartík, Ph.D. (člen) Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) doc. PhDr. Karel Pala (člen) Ing. Jaroslav Rozman, Ph.D. (člen)
Date of defence
2012-06-20
Process of defence
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázku oponenta a na doplňující dotazy přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm " D ". Otázky u obhajoby: 1. Jaké jiné přístupy k filtraci výsledků než ty, které jste použil v práci by se dali ještě aplikovat? Které vlastnosti hledaných sekvencí filtraci stěžují/ulehčují?
Result of the defence
práce byla úspěšně obhájena
Persistent identifier
http://hdl.handle.net/11012/53667
Source
DIVILA, J. Vyhledávání přibližných palindromů v DNA sekvencích [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2012.
Collections
  • 2012 [213]
Citace PRO

Portal of libraries | Central library on Facebook
DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback | Theme by @mire NV
 

 

Browse

All of repositoryCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

My Account

LoginRegister

Statistics

View Usage Statistics

Portal of libraries | Central library on Facebook
DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback | Theme by @mire NV