Show simple item record

Bioinformatics Tool for Prediction of Protein Solubility

dc.contributor.advisorMartínek, Tomášcs
dc.contributor.authorČermák, Jiřícs
dc.date.accessioned2019-06-14T11:36:20Z
dc.date.available2019-06-14T11:36:20Z
dc.date.created2017cs
dc.identifier.citationČERMÁK, J. Bioinformatický nástroj pro predikci rozpustnosti proteinů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2017.cs
dc.identifier.other106439cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/69679
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/176538
dc.description.abstractAbychom dosáhli levnější a efektivnější výroby proteinů, musíme být schopni predikovat, zda budou proteiny rozpustné. V této práci se zabýváme vytvořením bioinformatických datových sad na základě databází Target Track a eSol, testováním příznaků používaných v existujících nástrojích zabývajících se rozpustností proteinů a tvorbou nového prediktoru. Přestože se nám nedaří vytvořit efektivní nástroj na predikci rozpustnosti proteinů, zjišťujeme, že ve většině případů staré příznaky na nové datové sadě nekorelují s rozpustností proteinů tak silně, jako tomu je u starších a menších datových sad.cs
dc.description.abstractTo achieve cheaper and more efficient protein production, we must be able to predict protein solubility. In this thesis, we describe creation of bioinformatic data sets based on Target Track and eSol databases, we test the features used in existing protein solubility prediction tools and create a new predictor. Even though we fail to create an effective prediction tool we find out that in most cases the old features tested on the new data do not correlate with protein solubility as strongly as others repot in older and smaller datasets.en
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectRozpustnost proteinůcs
dc.subjectStrojové učenícs
dc.subjectAgregace proteinůcs
dc.subjectProteinové inženýrstvícs
dc.subjectSyntéza proteinůcs
dc.subjectProtein solubilityen
dc.subjectMachine learningen
dc.subjectProtein Aggregationen
dc.subjectProtein engineeringen
dc.subjectProtein synthesisen
dc.titleBioinformatický nástroj pro predikci rozpustnosti proteinůcs
dc.title.alternativeBioinformatics Tool for Prediction of Protein Solubilityen
dc.typeTextcs
dcterms.dateAccepted2017-06-14cs
dcterms.modified2017-08-25-10:44:54cs
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
sync.item.dbid106439en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2019.06.14 13:36:20en
sync.item.modts2019.05.18 19:31:56en
dc.contributor.refereeHon, Jiřícs
dc.description.markDcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record