Show simple item record

Gene order conservation in bacterial genomes

dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorMartinková, Terezacs
dc.date.accessioned2019-03-30T01:35:10Z
dc.date.available2019-03-30T01:35:10Z
dc.date.created2018cs
dc.identifier.citationMARTINKOVÁ, T. Konzervace pozice genů v bakteriálních genomech [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2018.cs
dc.identifier.other112916cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/84270
dc.description.abstractTeoretická část práce se zabývá základními pojmy jako bakteriální genom, komparativní genomika a synteny bloky. Je zde vysvětleno, co synteny je a v čem spočívá její důležitost. Dále je v teoretické části zmíněn GenBank formát, jeho obsah a využití. Praktická část je zaměřena na vyhledávání podobností v sekvencích DNA referenční bakterie s vybranou bakterií, jejich setřídění pomocí hladového algoritmu a zobrazení podobnosti fylogenetickým stromem.cs
dc.description.abstractTheoretical part of the thesis deals with basic concepts such as bacterial genome, comparative genomics and mainly synteny blocks. Here is explained what synteny is and what is its importance. In the theoretical part, the GenBank format is also mentioned, its content and usage. The practical part is focused on searching similarities in DNA sequences of reference bacteria with selected bacteria, their sorting by means of greedy algorithm and visualization of similarities using phylogenetic tree.en
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectGencs
dc.subjectgenomcs
dc.subjectsyntenycs
dc.subjectkomparativní genomikacs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectCDScs
dc.subjectfylogenetikacs
dc.subjectbreakpointová metodacs
dc.subjectGeneen
dc.subjectgenomeen
dc.subjectsyntenyen
dc.subjectcomparative genomicsen
dc.subjectDNAen
dc.subjectCDSen
dc.subjectphylogeneticsen
dc.subjectbreakpoint methoden
dc.titleKonzervace pozice genů v bakteriálních genomechcs
dc.title.alternativeGene order conservation in bacterial genomesen
dc.typeTextcs
dcterms.dateAccepted2018-08-29cs
dcterms.modified2018-08-29-12:52:23cs
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
sync.item.dbid112916en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2019.06.20 09:16:55en
sync.item.modts2019.05.18 08:01:25en
dc.contributor.refereeSedlář, Karelcs
dc.description.markFcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record