DUŠA, M. Kvantitativní digitální holografická mikroskopie pomocí strojového učení [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2022.
Student se ve své práci zabýval využitím strojového učení pro predikci poloměru, pozice a refrakčního indexu částice z hologramu nasnímaného holografickým mikroskopem. V práci jsou využity snímky částic o velikostech, při kterých se projevuje Mie rozptyl a ten je zaznamenáván v podobě hologramu; tato práce se pak zabývá odhadem informací o měřených částicích za pomoci strojového učení. Práce využívá uměle vygenerované snímky za pomoci Deeptrack 2.0 i reálná naměřená data. Student se práci velmi aktivně věnoval, kde otestoval několik přístupů a to jak v implementaci pomocí Deeptrack 2.0, tak ve vlastní implementaci pomocí knihovny PyTorch. Velké množství prakticky odvedené práce se ale neodráží v samotném textu. Student se pustil do příliš rozsáhlého testování, kde následně neměl dostatek času pro dokončení textu samotného a práci dokončoval až na poslední chvíli, což bude i důvod proč práce působí odbytě. Po formální stránce je práce na průměrné úrovni. Obsahuje nekvalitní obrázky, velké množství gramatických chyb, překlepů a nesmyslných vět, ale díky využití LaTeXu pro vysázení práce je dodrženo správné formátování. V práci je citován dostatek kvalitních zdrojů. Teoretický popis je na lehce podprůměrné úrovni. Mnohé věci jsou nedostatečně nebo nevhodně popsány, což čtenáři znemožňuje pochopení mnoha částí teoretického popisu. Oceňuji zařazení rešerše využití popisovaných metod v odborných článcích pro tuto aplikaci. Praktická část je z mého pohledu popsána nejasně a nedostatečně. Místo obecné terminologie jsou v popisu praktické části jmenovány názvy použitých funkcí, což považuji za nevhodné. Výsledky obsahují velké množství grafů, ve kterých se čtenář snadno ztratí. I přes popsané nedostatky považuji práci za úspěšnou a zadání je splněno. Hodnotím stupněm C - 71 bodů.
Předložená diplomová práce se zabývá odhadem parametrů mikro a nano-částic z hologramu pomocí metod hlubokého učení. Jde o predikci pozice, poloměru a indexu lomu. Student využil jak simulovaná data, tak reálná data. Postupy implementoval v programovém prostředí Python a otestoval. První dvě kapitoly obsahují spíše teoretický úvod do problematiky. Jde o popis principů holografického zobrazování, teorie rozptylu, dále pak principy hlubokého učení a podrobněji pak popis sítě U-net. Myslím, že především část o rozptylu světla by si zasloužila podrobnější popis. Na druhou stranu, toto není přímo zmíněno v zadání práce. Kapitola 3 a 4 pak obsahuje popis implementace a souhrn dosažených výsledků. Tyto dvě kapitoly působí poměrně chaoticky a nejsou v nich zdůvodněny některé kroky (například proč byla implementace provedena jak v Pytorch, tak i v DeepTrack). V textu jsou také často uvedeny konkrétní funkce v PyTorch, místo aby byl použit obecnější popis. Dále v práci v podstatě chybí diskuze výsledků. Ty jsou prezentovány v příslušných kapitolách, v rámci nichž je uvedeno pouze nějaké stručné zhodnocení a student se tak v podstatě nezamýšlí nad dosaženými výsledky. K samotnému způsobu řešení zadání nemám připomínek. Velkou výtku mám ale k samotnému textu. Ten je na řadě míst napsán nesrozumitelně a po stránce gramatické je natolik tragický, že řada vět nedává vůbec smysl, což velmi degraduje kvalitu odevzdaného textu. Navíc pro první část práce byly zřejmě použité anglické zdroje a provedený překlad do českého jazyka není zcela korektní. Zde jen pro představu dva příklady: • „Při porovnání mezi modely z tab. 3.4 je model s kriteriální funkcí Hubber má více vrstev, tudíž dokáže vyextrahovat více informace z obrázku.“ • „Nicméně výsledky segmentace 2D Gaussových rozložení bylo neúčinné, proto byl pro tento parametr učení modelu vypuštěno.“ Bohužel takových formulací, gramatických chyb či překlepů jsou v textu desítky. Pokud k tomu připočtu například chybějící jednotky v tabulce 3.1.,nejednotný formát použité literatury či v textu chybějící odkazy na řadu obrázků, pak musím konstatovat, že text působí značně odbytým dojmem. Na druhé straně je nutné dodat, že téma a zadání práce je poměrně náročné a student dosáhl výsledků, které mohou být pro další směřování výzkumu v užitečné. Při návrhu hodnocení musím vzít v úvahu dvě hlavní výtky - podprůměrnou kvalitu odevzdaného textu a absenci diskuze, což bohužel sráží hodnocení práce na stupeň D/65b.
eVSKP id 142108