KOSKOVÁ, M. Vliv redukce nukleotidových denzitních vektorů na molekulární identifikaci organismů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2014.
Předložená bakalářská práce je z formálního hlediska na velmi dobré úrovni a v praktické části splňuje všechny body zadání. Studentka práci řešila po celý semestr a často konzultovala. Teoretický podklad práce samostatně nastudovala z odborné literatury. Text práce je přehledný a praktický způsob realizace zadání je srozumitelně popsán. Studentka vytvořila pro poskytnuté soubory dat referenční signály nukleotidových denzit pro druhy organismů a realizovala porovnávání signálů analyzovaných sekvencí s referenčními pomocí signálového zarovnávání a výpočtu euklidovských vzdáleností mezi denzitami nukleotidů dle různých biochemických vlastností. Získané výsledky jsou dobře prezentovány a diskutovány. Vytknout mohu menší míru samostatnosti při hledání způsobu řešení. Práci hodnotím jako kvalitní.
Studentka Markéta Kosková se zabývala návrhem a realizací metody pro klasifikaci organismů podle molekulárních znaků s využitím barcodingu. Jedná se o zajímavou problematiku, kdy je zkoumána možnost rozlišování organismů poměrně nově zavedenou metodikou analýzy genů mitochondriální DNA. Zajímavá je rovněž specifická numerická reprezentace symbolického zápisu DNA pomocí zjišťování četnosti výskytu jednotlivých nukleotidů. Text práce je v rozsahu 48 stran bez příloh a obsahuje seznam 23 relevantních odborných pramenů. Po formální stránce je práce standardně zpracovaná s čtivou úpravou a téměř bezchybnou typografií. V textu se občasně objevují formulační nepřesnosti, např. označení fyletická speciace jako speciace, při níž přibývá celkový počet druhů, nebo vysvětlení zkratky mRNA jako "mediánová RNA". Po odborné stránce je práce dobře koncipovaná, obsahuje všechny části řešení problému včetně vyhodnocení výsledků. V řešení nenacházím žádná pochybení, navržené řešení je vhodně implementováno, ověřeno a výsledky správně interpretovány. Práce má zajímavé a užitečné výsledky, které jsou využitelné při dalším výzkumu numerické analýzy DNA sekvencí pro identifikaci druhů.
eVSKP id 72828