ČERNÝ, Š. Modelování parametrické arteriální vstupní funkce v perfúzním zobrazování [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.
Student Štěpán Černý zpracoval problematiku modelování parametrické arteriální vstupní funkce v perfúzním zobrazování. Práce je logicky členěná a přehledná. V praktické části student naprogramoval jedenáct funkcí pro popis arteriální vstupní funkce a tyto modely poté optimalizačními přístupy aproximuje na reálné měřené křivky arteriální vstupní funkce, které získal extrakcí z reálných měření metodou DCE-MRI. K tomu využil dodaný software, kde musel provést jednotlivé kroky perfúzní analýzy a poté v sekvencích dat najít vhodný signál z artérie. Student logicky vyhodnocuje výsledky, kdy nejprve ověřuje funkčnost aproximačního algoritmu na nezašuměné modelované předlohy, poté aproximuje navržené modely na reálné křivky, snaží se výsledky diskutovat z hlediska vizuální podoby i kvantitativně a hledat vhodný kompromis mezi složitostí modelu z hlediska počtu optimalizovaných parametrů a jeho schopností vhodně aproximovat reálná data. Oceňuji i snahu o analýzu robustnosti aproximačního algoritmu a modelů vůči různým úrovním zašumění předlohy a také diskusi rozdílů výsledků aproximace při použití různých optimalizačních metod. Dále student vytvořil aplikaci v Matlabu GUI, která uživateli slouží pro výběry modelů a reálných dat a jejich aproximaci. Student konzultoval pravidelně, ve stěžejním období ale jeho aktivita ochabla, což se projevilo v závěru, kdy se student dostal do časové tísně. Z hlediska programové části student pracoval samostatně, velký problém ale nastal při zpracování textu bakalářské práce, student měl nedostatky ve schopnosti správně své výsledky prezentovat a zásadní problém měl student s formální stránkou práce a uměním se v práci vyjadřovat i s přihlédnutím k faktu, že jde o první studentovu práci v takovém rozsahu. Toto se s větší pomocí podařilo změnit a předkládaná práce tak splňuje požadavky na bakalářskou práci i po této stránce. Bohužel stále zůstávají v práci chyby, byť na některé byl student opakovaně upozorňován, to je způsobeno právě vzniklou časovou tísní v závěru řešení práce. Za všechny nedostatky, pominu-li občasné gramatické chyby a překlepy, uvádím číslování obsahu, kde se vyskytují nulté strany, dále z hlediska vyhodnocení stěžejní vzorec 14 na straně 39, kde není uvedeno přes kterou proměnnou je suma počítána, přesto, že byl na to opakovaně upozorňován a konečně Obrázek 31 s blokovým schématem naprogramované funkce, který není zcela přesný. Přesto je úroveň práce z hlediska technické a formální stránky velmi dobrá a aktivita studenta v samotném závěru až heroická. Hodnotím stupněm velmi dobře.
Předložená práce se zabývá modely arteriální vstupní funkce pro perfusní zobrazování magnetickou rezonancí. Student v teoretické části popsal zobrazování magnetickou rezonancí, metodiku akvizice a zpracování dat v perfusním zobrazování a matematické modely vhodné pro popis arteriální vstupní funkce. V praktické části tyto modely implementoval a vytvořil program pro simulaci a odhad parametrů arteriální vstupní funkce z reáných dat. Tento algoritmus otestoval a vyhodnotil na základě dodaných klinických a preklinických dat. Práce je svým rozsahem dostatečná i na diplomovou práci. Postup práce a vyhodnocení je korektní a logický, vyvozené závěry jsou správné. V textu se středně často vyskytují nepřesnosti a gramatické chyby. Např. rovnice (8) a (9) jsou neúplné, chybí zde specifikace časových intervalů. Seznam literatury je částečně nekonzistentní, položka [9] je špatně. Vzhledem k těmto formálním nedostatkům práci celkově nehodnotím jako výbornou ale velmi dobrou a doporučuji ji k obhajobě.
eVSKP id 65370