Změny proteinového profilu v průběhu sladování ječmene
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract
Tato diplomová práce se zabývá studiem změn proteinového profilu ječmene během procesu sladování. Podstatná část práce se věnuje proteomické identifikaci ječných proteinů, které se během sladování mění, stávají se stabilnějšími a v konečném důsledku ovlivňují vlastnosti piva (např. pěnu a zákal). Jako vzorek byl použit ječmen odrůdy Jersey. V literární části jsou uvedeny obecné informace o pivu, o procesu jeho výroby s popisem důležitých surovin pro výrobu a informace o sladovnickém ječmeni a procesu sladování. Dále jsou popsány použité metody separace proteinů (1D a 2D gelová elektroforéza), hmotnostní spektrometrie MALDI TOF/TOF a její využití k analýze a identifikaci proteinů, použití matric a způsoby přípravy vzorků. V experimentální části byla provedena optimalizace dávkování vzorku pro 1D gelovou elektroforézu a optimalizace vizualizace. Nejlepší výsledky byly dosaženy u 15 % TRIS-HCl gelu, který byl obarven barvivem Commassie Brilliant Blue G-250. Pro ilustraci změn byla provedena i 2D gelová elektroforéza. Pomocí metody peptidového mapování a MS/MS byly identifikovány ječné proteiny – protein Z, -amylasa subtilisin inhibitor, -amylasa a peroxidasa. Byla provedena analýza intaktních proteinů, která byla zaměřena na sledování změn u významného proteinu ječmene LTP 1.
This diploma thesis is focused on studies of changing of protein profile during barley malting. Substantial part of this work is devoted to the proteomics identification of barley proteins which change during malting and so become more stationary and they influence quality of beer (haze and foam in beer). For this experiment was used barley variety Jersey. In the theoretical part of this thesis there is information about beer, manufacturing of beer with description of important commodities for manufacturing of beer and information about barley malting and information about malting process. Next there is description of methods for separation of proteins (1D gel electrophoresis and 2D gel electrophoresis), MALDI TOF/TOF mass spectrometry and this use for the analysis and identification of proteins, the use of matrices and ways of the sample preparation. In the experimental part of this thesis there was carried out the optimisation of the dosage of sample for 1D gel electrophoresis and the optimisation of staining. The 15 % TRIS-HCl gel was the best, this gel was stained by Commassie Brilliant Blue G-250. For illustration of changes was made 2D gel electrophoresis. With help of method peptide mass fingerprinting and MS/MS protein of barley – protein Z, -amylase subtilisin inhibitor, -amylase a peroxidase were identificated. The analysis of barley extract intact proteins was carried out, this analysis was focused on changes of important barley protein LTP 1.
This diploma thesis is focused on studies of changing of protein profile during barley malting. Substantial part of this work is devoted to the proteomics identification of barley proteins which change during malting and so become more stationary and they influence quality of beer (haze and foam in beer). For this experiment was used barley variety Jersey. In the theoretical part of this thesis there is information about beer, manufacturing of beer with description of important commodities for manufacturing of beer and information about barley malting and information about malting process. Next there is description of methods for separation of proteins (1D gel electrophoresis and 2D gel electrophoresis), MALDI TOF/TOF mass spectrometry and this use for the analysis and identification of proteins, the use of matrices and ways of the sample preparation. In the experimental part of this thesis there was carried out the optimisation of the dosage of sample for 1D gel electrophoresis and the optimisation of staining. The 15 % TRIS-HCl gel was the best, this gel was stained by Commassie Brilliant Blue G-250. For illustration of changes was made 2D gel electrophoresis. With help of method peptide mass fingerprinting and MS/MS protein of barley – protein Z, -amylase subtilisin inhibitor, -amylase a peroxidase were identificated. The analysis of barley extract intact proteins was carried out, this analysis was focused on changes of important barley protein LTP 1.
Description
Citation
ŠOPÍKOVÁ, M. Změny proteinového profilu v průběhu sladování ječmene [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2008.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Potravinářská chemie a biotechnologie
Comittee
prof. Ing. Peter Šimko, DrSc. (předseda)
doc. Ing. Jiřina Omelková, CSc. (místopředseda)
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (člen)
prof. RNDr. Milan Potáček, CSc. (člen)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (člen)
prof. Ing. Mojmír Rychtera, CSc. (člen)
Date of acceptance
2008-06-11
Defence
1. Diplomantka seznámila členy komise s náplní a cílem diplomové práce.
2. Byly přečteny posudky na diplomovou práci.
3. Diplomantka akceptovala všechny připomínky oponenta a na všechny otázky odpověděla v plné šíři.
4. Diskuse:
doc. Márová: Jakou molekulovou hmotnost má LTP1? Proteomy 2D jsou z celého zrna nebo z některých frakcí?
prof. Šimko: Měli jste na vyhodnocení gelů 2D elektroforézy k dispozici software?
prof. Rychtera: Podle čeho usuzujete, že protein Z odpovídá za pěnění piva?
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Přístup k plnému textu prostřednictvím internetu byl licenční smlouvou omezen na dobu 1 roku/let