Biologická role PHA cyklu u bakterie Rhodospirillum rubrum
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract
Diplomová práca sa zaoberá štúdiom produkcie polyhydroxyalkanoátov (PHA) a ich protektívnymi účinkami pri vystavení bakteriálneho kmeňa Rhodospirillum rubrum rôznym stresovým faktorom. Teoretická časť tejto práce sa venuje charakterizácii polyhydroxyalkanoátov a použitého bakteriálneho kmeňa. V prvej časti experimentálnej práce boli skúmané vybrané uhlíkové substráty pre nárast biomasy a produkciu PHA v rôznych časových intervaloch (24, 48, 72 a 96 hodín). Ako zdroj uhlíka slúžil acetát, fruktóza, hexanoát a malát. Druhá časť práce bola zameraná na výber vhodnej fluorescenčnej sondy pre baktériu Rhodospirillum rubrum (propidium jodid, SYTOXTM, fluoresceín diacetát), ktorá slúžila na stanovenie viability bakteriálnych buniek pomocou prietokovej cytometrie. Touto metódou bola stanovená viabilita bakteriálnych buniek po ich expozícii rôznym stresovým faktorom (teplotný stres, mrazenie a rozmrazenie, etanolový stres, osmotický stres, peroxidový stres, pH stres, UV stres). Nakoniec bola meraním optickej hustoty stanovená rastová krivka baktérie Rhodospirillum rubrum.
The diploma thesis deals with the study of polyhydroxyalkanoates (PHAs) production and their protective effects during exposure of the bacterial strain Rhodospirillum rubrum to various stress factors. The theoretical part of this work is focused on the characterization of PHAs and used bacterial strain. In the first part of the experimental work carbon substrates for biomass growth and PHA production in different time intervals (24, 48, 72 and 96 hours) were investigated. Acetate, fructose, hexanoate and malate served as a carbon source. The second part of this work was focused on the selection of a suitable fluorescent probe for the bacterium Rhodospirillum rubrum (propidium iodide, SYTOXTM, fluorescein diacetate), which was used to determine the viability of bacterial cells using flow cytometry. This method was used to determine the viability of bacterial cells after their exposure to various stress factors (thermal stress, freezing and thawing, ethanol stress, osmotic stress, peroxide stress, pH stress and UV stress). Finally, the growth curve of bacteria Rhodospirillum rubrum was determined by measurement of the optical density.
The diploma thesis deals with the study of polyhydroxyalkanoates (PHAs) production and their protective effects during exposure of the bacterial strain Rhodospirillum rubrum to various stress factors. The theoretical part of this work is focused on the characterization of PHAs and used bacterial strain. In the first part of the experimental work carbon substrates for biomass growth and PHA production in different time intervals (24, 48, 72 and 96 hours) were investigated. Acetate, fructose, hexanoate and malate served as a carbon source. The second part of this work was focused on the selection of a suitable fluorescent probe for the bacterium Rhodospirillum rubrum (propidium iodide, SYTOXTM, fluorescein diacetate), which was used to determine the viability of bacterial cells using flow cytometry. This method was used to determine the viability of bacterial cells after their exposure to various stress factors (thermal stress, freezing and thawing, ethanol stress, osmotic stress, peroxide stress, pH stress and UV stress). Finally, the growth curve of bacteria Rhodospirillum rubrum was determined by measurement of the optical density.
Description
Citation
ŠARKÖZIOVÁ, P. Biologická role PHA cyklu u bakterie Rhodospirillum rubrum [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2022.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Chemie pro medicínské aplikace
Comittee
prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (předseda)
doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (místopředseda)
doc. Ing. Adriána Kovalčík, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Filip Mravec, Ph.D. (člen)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (člen)
Date of acceptance
2022-05-23
Defence
1. Studentka seznámila členy komise s náplní a cílem diplomové práce.
2. Byly přečteny posudky na diplomovou práci.
3. Studentka akceptovala všechny připomínky oponentky a na všechny otázky odpověděla v plné šíři.
Diskuse
doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D.
Čím je daný rozdíl mezi mrtvými a živými buňkami při použití dané sondy?
V záznamu z průtokové cytometrie jde poznat rozdíl shluků živých a mrtvých buněk, v některých záznamech je tento signál posunutý, čím je to způsobené?
doc. Ing. Adriána Kovalčík, Ph.D.
Při naměření růstové křivky jste v jednom bodu detekovali vznik kopolymeru P(3HB-co-3HV), detekovali jste ho i v jiných odběrech? Je to zmíněno i v literatuře?
doc. Ing. Filip Mravec, Ph.D.
V záznamu spekter uvádíte intenzitu daných látek, jedná se o šum?
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
Při vypracování Vaší experimentální práce jste využívala průtoková cytometrii, byly Vám výsledky poskytnuty nebo jste je měřila sama?
Studentka odpověděla na všechny doplňující otázky členů komise, které byly v průběhu diskuze k dané problematice vzneseny. V diskuzi studentka prokázala výbornou orientace v dané problematice. Po diskusi následovalo hodnocení závěrečné práce. Diplomantka prokázala nejen výborné odborné znalosti, ale i schopnost samostatné prezentace dosažených výsledků.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení