Interpretace dat z biočipů
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
C
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstract
Tato práce se zabývá interpretací dat získaných pomocí technologie biočipů. Práce obsahuje také krátký úvod do problematiky genetické informace a jejího významu. Jádrem práce je pak sada skriptů provádějící analýzy nad testovacími daty. Jako vstupní data jsou použity výstupy biočipové analýzy tkání s rakovinou tlustého střeva. Dílčí výsledek je určení genových markerů rakoviny tlustého střeva. Finální výsledek určuje postavení markerů v kontextu objevených signálních drah, ty jsou nakonec seřazeny dle relevance.
This Bachelor thesis explains the basics of biochip or microarray data interpretation, starting with short introduction to genetics, especially genetic information significance evaluating. The focus was set mainly on the set of scripts transforming and analyzing the sample data. The data used in this thesis are a result of biochip analysis of the Colon Tumor tissues. The secondary result represents disclosing the main marker for this particular type of cancer, the primary result is evaluation of marker significance in the context of signaling pathways. The resulting pathways are sorted by relevance.
This Bachelor thesis explains the basics of biochip or microarray data interpretation, starting with short introduction to genetics, especially genetic information significance evaluating. The focus was set mainly on the set of scripts transforming and analyzing the sample data. The data used in this thesis are a result of biochip analysis of the Colon Tumor tissues. The secondary result represents disclosing the main marker for this particular type of cancer, the primary result is evaluation of marker significance in the context of signaling pathways. The resulting pathways are sorted by relevance.
Description
Keywords
biočip, genové signální dráhy, genová ontologie, Desmin, bioinformatika, genetika, geny, exprese genů, down regulace, up regulace, KEGG, BioRuby, Ruby, rakovina, karcinom, tumor, tlusté střevo, DNA, RNA, nukleové kyseliny, biochip, microarray, signaling pathways, gene ontology, Desmin, bioinformatics, genetics, genes expression, downregulation, upregulation, KEGG, BioRuby, Ruby, cancer, tumor, colon, DNA, RNA, nucleus acids
Citation
LUDWIG, P. Interpretace dat z biočipů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2008.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Informační technologie
Comittee
Date of acceptance
2008-06-12
Defence
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení