Zpracování obrazu Petriho misek
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstract
Tato práce se zabývá zpracováním obrazu na Petriho miskách. V první části práce je souhrn odborných výrazů a postupů v laboratorní praxi. Následuje přehled zařízení a algoritmů pro analýzu obrazu Petriho misek. V druhé části je návrh a implementace vlastní aplikace pro automatické počítání bakteriálních kolonií, která byla vyvíjena ve spolupráci s mikrobiologickou laboratoří. Aplikace je určena pro mobilní zařízení s operačním systémem Android. Součástí práce je také návrh a vytvoření dvou osvětlovacích jednotek, které slouží jako příslušenství pro dosažení lepších výsledků při analýze Petriho misky. V závěru práce jsou uvedeny dosažené výsledky, porovnání osvětlovacích jednotek a různých typů mobilních zařízení, na kterých byla aplikace testována.
This master thesis deals with image processing of Petri dishes. The first part is about terms and procedures in laboratory practice. The following part is about devices and algorithms for image analysis of Petri dishes. The second part is about draft and implementation of own colony counting application, which was developed in cooperation with the microbiological laboratory. The application is developed for mobile devices running Android OS. The master thesis also includes the design and creation of two lighting units, which uses as an accessory for better results in the analysis of Petri dishes. In conclusion are presented results, compared lighting units and various types of mobile devices, on which the application was tested.
This master thesis deals with image processing of Petri dishes. The first part is about terms and procedures in laboratory practice. The following part is about devices and algorithms for image analysis of Petri dishes. The second part is about draft and implementation of own colony counting application, which was developed in cooperation with the microbiological laboratory. The application is developed for mobile devices running Android OS. The master thesis also includes the design and creation of two lighting units, which uses as an accessory for better results in the analysis of Petri dishes. In conclusion are presented results, compared lighting units and various types of mobile devices, on which the application was tested.
Description
Keywords
kolonie bakterií, zpracování obrazu, Petriho miska, počítání kolonií, nástroje pro počítání kolonií, agar, mikrobiologie, prahování, watershed, morfologické operace, ColonyCatcher, bacterial colony, image processing, Petri dish, colony counting, devices for colony counting, agar, microbiology, thresholding, watershed, morphology operations, ColonyCatcher
Citation
ADÁMEK, J. Zpracování obrazu Petriho misek [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2015.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Počítačová grafika a multimédia
Comittee
doc. Dr. Ing. Jan Černocký (předseda)
doc. RNDr. Pavel Smrž, Ph.D. (místopředseda)
prof. Ing. Adam Herout, Ph.D. (člen)
doc. Mgr. Jaroslav Hrdina, Ph.D. (člen)
Ing. Zbyněk Křivka, Ph.D. (člen)
Ing. Josef Strnadel, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2015-06-22
Defence
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A. Otázky u obhajoby: Jak focení z ruky vyhovuje ergonomii práce laboranta? Nebylo by vhodné kalibrovat konkrétní zařízení, aby výsledkem byly co nejvíce nevychýlené odhady počtu kolonií? Jak byste upravoval citlivost (operační bod) automatické detekce? Nebylo by vhodné, aby laborant tuto vlastnost mohl přímo nastavovat?
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení