Hledání vhodných deskriptorů pro popis bakteriálních genomů
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
C
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstract
Táto bakalárska práca sa zaoberá skúmaním DNA sekvencií genómov rôznych baktérií. Cieľom je určiť, či je možné na základe počtov n-tíc nukleotidov zistiť, z ktorej baktérie, resp. druhu baktérií sekvencia pochádza. Výsledky skúmania boli získané pomocou nástroja, ktorého realizácia tvorí súčasť práce. Výstupom tejto práce sú experimenty so sekvenciami na báze štatistických výpočtov s frekvenciami n-tíc a rozhodnutie, či je tento prístup prínosný.
This bachelor thesis deals with the investigation of DNA sequences of bacterial genomes. The aim is to find out whether it is possible to determine on the basis of the nucleotide tuple frequencies from which bacteria specie the examined sequence originates. The investigation results were obtained by a tool whose implementation is also a part of the work. The output of this thesis are the experiments with nucleotide tuple frequencies based on statistical calculations and decision whether this approach is beneficial or not.
This bachelor thesis deals with the investigation of DNA sequences of bacterial genomes. The aim is to find out whether it is possible to determine on the basis of the nucleotide tuple frequencies from which bacteria specie the examined sequence originates. The investigation results were obtained by a tool whose implementation is also a part of the work. The output of this thesis are the experiments with nucleotide tuple frequencies based on statistical calculations and decision whether this approach is beneficial or not.
Description
Citation
VANEK, R. Hledání vhodných deskriptorů pro popis bakteriálních genomů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2017.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Informační technologie
Comittee
prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda)
prof. Ing. Miroslav Švéda, CSc. (místopředseda)
Ing. Jaroslav Dytrych, Ph.D. (člen)
Ing. Martin Hrubý, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Jan Kořenek, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2017-06-14
Defence
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm C. Otázky u obhajoby: Máte představu, jak hodnocení přesnosti vašeho klasifikátoru ovlivňuje konkrétní výběr 13-ti sekvencí bakteriálních genomů? Napadá vás, jak fázi testování učinit více nezávislou?
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení