Preference synonymních kodonů v mitochondriálním genomu

Loading...
Thumbnail Image
Date
ORCID
Mark
C
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Tato bakalářská práce se zabývá preferencí synonymních kodonů v mitochondriálním genomu. Jsou zde teoreticky rozebrány základní pojmy z oblastí bioinformatiky a genetiky. Kodonová preference je představena spolu s parametry, které ji charakterizují. Praktická část bakalářské práce se zabývá návrhem funkcí pro výpočet parametrů kodonové preference. Mezi naprogramovanými parametry je relativní četnost synonymních kodonů, relativní adaptační index, kodonový adaptační index a homozygotnost kodonů. Dále je provedena analýza kodonové preference u mitochondriálního genomu Homo sapiens.
This Bachelors thesis deals with synonymous codon usage bias in mitochondrial genomes. This thesis covers basic terms of bioinformatics and genetics. Codon usage bias is introduced together with parameters that characterize it. Practical part of the thesis is dealing with programs that are designed to calculate parameters of codon usage bias. Programs that are described in this thesis are relative synonymous codon usage, relative adaptation index, codon adaptation index, homozygosity of codons, and effective number of codons. Synonymous codon usage bias in mitochondrial genome of Homo sapiens is analysed.
Description
Citation
URBANOVÁ, H. Preference synonymních kodonů v mitochondriálním genomu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2018.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínská technika a bioinformatika
Comittee
doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Martin Augustynek, Ph.D. (místopředseda) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) Ing. Jiří Sekora (člen) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen) Mgr. Veronika Bulková, Ph.D., MHA. (člen)
Date of acceptance
2018-06-15
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Studentka obhájila bakalářskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení
DOI
Collections
Citace PRO