Efektivní analýza stochastických biochemických systémů

but.committeeprof. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D. (předseda) prof. Ing. Jan M. Honzík, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Martin Čadík, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Kořenek, Ph.D. (člen) Ing. Aleš Smrčka, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka nejprve prezentovala výsledky, kterých dosáhla v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Studentka následně odpověděla na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studentky na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm " C ". Otázky u obhajoby: Proč jste v experimentech nepracovala více s modely biochemických systému, když jsou zmíněny v názvu práce? Bude Vaše práce zařazena do nástroje STORM jeho autory?cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorČeška, Milancs
dc.contributor.authorTušimová, Luciacs
dc.contributor.refereeHruška, Martincs
dc.date.accessioned2018-09-07T13:00:51Z
dc.date.available2018-09-07T13:00:51Z
dc.date.created2018cs
dc.description.abstractCieľom tejto práce je zefektívniť výpočet biochemických reakčných sietí. Na modelovanie biochemických systémov pomocou numerických metód sa používajú Markovove reťazce v spojitom čase. Problémom pri biochemických reakciách je vznik nezvládnuteľného množstva stavov. Metóda rýchlej adaptívnej uniformizácie rieši tento problém za cenu malej zaokrúhľovacej chyby. Táto metóda bola implementovaná v nástroji STORM, ktorý slúži na analýzu systémov obsahujúcich pravdepodobnostné javy. Následne bola efektivita tejto metódy overená na sade experimentov.cs
dc.description.abstractThe aim of the thesis is to make computation of the biochemical reaction networks more efficient. Modeling of biochemical systems using numerical methods uses continuous-time Markov chains. The problem is that in biochemical reactions arises an unmanageable amount of states. The fast adaptive uniformization method solves this problem at the cost of a small rounding mistake. This method was implemented in the STORM, which is tool for the analysis of systems involving random or probabilistic phenomena. Consequently, the effectiveness of this method was verified on a set of experiments.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationTUŠIMOVÁ, L. Efektivní analýza stochastických biochemických systémů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2018.cs
dc.identifier.other114873cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/85029
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectBiochemické modelycs
dc.subjectMarkovove reťazce v spojitom časecs
dc.subjectRýchla adaptívna uniformizáciacs
dc.subjectSTORMcs
dc.subjectBiochemical modelsen
dc.subjectContinuous-time Markov chainen
dc.subjectFast adaptive uniformizationen
dc.subjectSTORMen
dc.titleEfektivní analýza stochastických biochemických systémůcs
dc.title.alternativeEfficient Analysis of Stochastic Biochemical Systemsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2018-06-11cs
dcterms.modified2020-05-10-16:13:27cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid114873en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.08 13:00:16en
sync.item.modts2021.11.08 12:18:58en
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav inteligentních systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 4 of 4
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.23 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Vedouci prace-21187_v.pdf
Size:
86.54 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Vedouci prace-21187_v.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-21187_o.pdf
Size:
88.57 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Oponent prace-21187_o.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_114873.html
Size:
1.46 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_114873.html
Collections