Genotypizace bakterií na základě teploty tání oligonukleotidů

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Martin Augustynek, Ph.D. (místopředseda) Ing. Helena Škutková, Ph.D. (člen) Ing. Jakub Hejč (člen) Mgr. Daniel Vlk, CSc. (člen) MUDr. Tibor Stračina, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Mgr. Vlk položil otázku - co je to teplota tání oligonukleotidů? Ing. Hejč položil otázku na velikost prostoru pro klasifikaci dat. Studentka obhájila bakalářskou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorNykrýnová, Markétacs
dc.contributor.authorŠandová, Hanacs
dc.contributor.refereeŠkutková, Helenacs
dc.date.accessioned2020-06-24T07:57:09Z
dc.date.available2020-06-24T07:57:09Z
dc.date.created2020cs
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá genotypizačními metodami, které využívají teplotu tání oligonukleotidů. V teoretické části je popsána DNA, je vysvětlen pojem typizace a jsou zde popsány laboratorní i výpočetní metody genotypizace. V praktické části byly v programovacím prostředí MATLAB navrženy funkce pro výpočet teploty tání ze sekvence a pro jejich spuštění bylo vytvořeno grafické uživatelské prostředí. Dále byla zpracovávána reálná data změřená pro 52 izolátů bakterie Klebsiella pneumoniae poskytnutá FN Brno. Byly porovnávány laboratorně určené teploty tání s teoretickými výpočty. Nakonec bylo zjišťováno, zda je možná klasifikace bakterií shlukovacími metodami na základě teoreticky vypočtených teplot tání oligonukleotidů.cs
dc.description.abstractThis bachelor’s thesis deals with genotyping based on the oligonucleotide melting temperatures. In the theoretical part, DNA, typing, experimental and theoretical genotyping methods are described. The practical part of the thesis deals with a program that is designed to calculate the melting temperatures of sequences based on different methods, and the graphical user interface was created. In the following part, the measured melting temperatures of bacterial isolates of Klebsiella pneumoniae are compared to the theoretically calculated melting temperatures. In the last part of the thesis, the possibility of genotyping using cluster analysis based on the theoretical melting temperatures is explored.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationŠANDOVÁ, H. Genotypizace bakterií na základě teploty tání oligonukleotidů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2020.cs
dc.identifier.other126727cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/190321
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectTeplota tánícs
dc.subjectgenotypizacecs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectmini-multilokusová sekvenční typizacecs
dc.subjectvysokorozlišovací analýza křivek tánícs
dc.subjectMelting temperatureen
dc.subjectgenotypingen
dc.subjectDNAen
dc.subjectminim typingen
dc.subjectHigh Resolution Melting analysisen
dc.titleGenotypizace bakterií na základě teploty tání oligonukleotidůcs
dc.title.alternativeBacterial genotyping based on the oligonucleotide melting temperatureen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2020-06-23cs
dcterms.modified2020-06-25-09:17:26cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid126727en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.10 14:02:30en
sync.item.modts2021.11.10 13:46:20en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.52 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
10.59 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_126727.html
Size:
5.45 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_126727.html
Download
Collections
2020