Vývoj biofyzikální interpretace dat kvantitativního fázového zobrazování

but.committeeprof. RNDr. Petr Dub, CSc. (předseda) Ing. Petr Jákl, Ph.D. (člen) Ing. Tomáš Vomastek, Ph.D. (člen) prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Jiří Petráček, Dr. (člen)cs
but.defenceDDP významně přispívá k rozšíření možností aplikace koherencí řízeného holografického mikroskopu a obecněji také metod nekoherentního holografického kvantitativního fázového zobrazení (hiQPI) v biologii živé buňky tím, že navrhla a ověřila korektní postupy při pozorování buněk ve 2D i 3D prostředích a biofyzikální metody interpretace takto získávaných obrazových dat.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programFyzikální a materiálové inženýrstvícs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorChmelík, Radimcs
dc.contributor.authorKřížová, Anetacs
dc.contributor.refereeJákl, Petrcs
dc.contributor.refereeVomastek, Tomášcs
dc.date.accessioned2019-06-14T11:05:41Z
dc.date.available2019-06-14T11:05:41Z
dc.date.created2019cs
dc.description.abstractDoktorská práce se zabývá biofyzikální interpretací dat kvantitativního fázového zobrazování (QPI – quantitative phase imaging) získaného pomocí koherencí řízeného holografického mikroskopu (CCHM – coherence-controlled holographic microscope). V práci jsou nejprve popsány metody vyhodnocující informace z QPI jako analýza tvarových a dynamických cha-rakteristik segmentovaných objektů a také vyhodnocování samotné fázové informace. Dále je navržena metoda dynamických fázových diferencí (DPD – dynamic phase differences), která umožňuje detailněji sledovat přesuny hmoty uvnitř buněk. Všechny uvedené metody jsou pak využity v biologických aplikacích. V rozsáhlé studii různých typů buněčných smrtí jsou informace z QPI porovnány s daty z průtokové cytometrie a s výhodou je využita kombinace QPI a fluorescenční mikroskopie. Metoda DPD je pak využita při studiu přesunů hmoty uvnitř buňky při osmotických jevech. Zjednodušená metoda DPD je aplikována při výzkumu mechanizmu pohybu nádorových buněk v kolagenových gelech.cs
dc.description.abstractThis doctoral thesis deals with biophysical interpretation of quantitative phase imaging (QPI) gained with coherence-controlled holographic microscope (CCHM). In the first part methods evaluating information from QPI such as analysis of shape and dynamical characteristics of segmented objects as well as evaluation of the phase information itself are described. In addition, a method of dynamic phase differences (DPD) is designed to allow more detailed monitoring of cell mass translocations. All of these methods are used in biological applications. In an extensive study of various types of cell death, QPI information is compared with flow cytometry data, and preferably a combination of QPI and fluorescence microscopy is used. The DPD method is used to study mass translocations inside the cell during osmotic events. The simplified DPD method is applied to investigate the mechanism of tumor cell movement in collagen gels.en
dc.description.markPcs
dc.identifier.citationKŘÍŽOVÁ, A. Vývoj biofyzikální interpretace dat kvantitativního fázového zobrazování [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. 2019.cs
dc.identifier.other113796cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/176156
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrstvícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectKoherencí řízený holografický mikroskopcs
dc.subjectkvantitativní fázové zobrazovánícs
dc.subjectdynamické fázové diferencecs
dc.subjectbuněčná smrtcs
dc.subjectosmotické jevycs
dc.subjectzobrazování ve 3D prostředíchcs
dc.subjectdynamika buněkcs
dc.subjectkolagenové gelycs
dc.subjectfiltrace prostorových frekvencí.cs
dc.subjectCoherence-controlled holographic microscopeen
dc.subjectquantitative phase imagingen
dc.subjectdynamic phase differencesen
dc.subjectcell deathen
dc.subjectosmotic challengeen
dc.subjectimaging in 3D environmentsen
dc.subjectcell dynamicsen
dc.subjectcollagen gelsen
dc.subjectspatial frequencies filtration.en
dc.titleVývoj biofyzikální interpretace dat kvantitativního fázového zobrazovánícs
dc.title.alternativeDevelopment of Biophysical Interpretation of Quantitative Phase Image Dataen
dc.typeTextcs
dc.type.driverdoctoralThesisen
dc.type.evskpdizertační prácecs
dcterms.dateAccepted2019-04-11cs
dcterms.modified2019-04-29-14:33:41cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta strojního inženýrstvícs
sync.item.dbid113796en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.22 23:20:47en
sync.item.modts2021.11.22 21:52:18en
thesis.disciplineFyzikální a materiálové inženýrstvícs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství. Ústav fyzikálního inženýrstvícs
thesis.levelDoktorskýcs
thesis.namePh.D.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 5 of 6
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
4.48 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
thesis-1.pdf
Size:
2.2 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
thesis-1.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Vedouci prace-stanovisko skolitele.pdf
Size:
55.06 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Vedouci prace-stanovisko skolitele.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-Ing. Petr Jakl Ph.D.pdf
Size:
71.25 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Oponent prace-Ing. Petr Jakl Ph.D.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-Oponentsky posudek A.Krizova.pdf
Size:
596.87 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Oponent prace-Oponentsky posudek A.Krizova.pdf
Collections