Techniky pro porovnávání biologických sekvencí

Simple item page
but.committeecs
but.defencecs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorBurgetová, Ivanacs
dc.contributor.authorSladký, Romancs
dc.contributor.refereeKřivka, Zbyněkcs
dc.date.accessioned2018-10-21T20:54:59Z
dc.date.available2018-10-21T20:54:59Z
dc.date.created2008cs
dc.description.abstractV práci se seznámíme se výstavbou a funkcí základních biologických jednotek DNA, RNA a proteinů. Data, která poskytují, se uchovávají v biologických databázích, které jsou celosvětově propojeny pro lepší komunikaci a dostupnost veškerých informací při vědeckém bádání. Tajemství života je skryto v genech. Geny jsou kódovány sekvencemi nukleotidů a dávají vznik proteinům, které jsou tvořeny sekvencemi aminokyselin. Nejrozšířenějšími technikami pro porovnávání sekvencí jsou algoritmy FASTA a BLAST. V práci je popsán program PSProt, který je založen na bázi zmíněných algoritmů. Slouží k porovnávání sekvencí proteinů. Porovnávaný protein se ale nejdříve pomyslně syntetizuje ze zadaného oligonukleotidu DNA, který kóduje potenciální protein. Nejpodobnější proteiny jsou pak vyhledány heuristikou hitbodů a poté algoritmem semiglobálního zarovnání upraveno jejich výsledné skóre rozhodující pro vyhledávání.cs
dc.description.abstractThis work presents the building up of basic biological units DNA, RNA and proteins as well as their function. Provided data are kept in biological databases which are connected worldwide to supply preferable communication along with all kinds of available information to be used in the scientific research. The secret of alive is hidden in genes coded in sequences of nucleotides. Genes enable the creation of proteins which are made of sequences of amino-acids. The wide-spread methods of comparing these sequences are FASTA and BLAST algorithms. Their base is used for the PSProt program which is described in this work. PSProt program is the tool for comparing the sequences of proteins. First it is necessary to synthesise the protein from the DNA oligonucleotide because it codes the surveyed protein. The most similar proteins are searched out by heuristic of hitpoints, then their final score that is essential for aligning is modified by semiglobal alignment algorithm.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationSLADKÝ, R. Techniky pro porovnávání biologických sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2008.cs
dc.identifier.other25434cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/53133
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectMolekulární biologiecs
dc.subjectDNAcs
dc.subjectRNAcs
dc.subjectnukleotidcs
dc.subjectaminokyselinacs
dc.subjectproteincs
dc.subjectdatabázecs
dc.subjectEBIcs
dc.subjectENBL-Bankcs
dc.subjectSwiss-Protcs
dc.subjectTrEMBLcs
dc.subjectPDBcs
dc.subjectEnSemblcs
dc.subjectNeedlemann-Wunschcs
dc.subjectmatice PAM a BLOSUMcs
dc.subjectBLASTcs
dc.subjectFASTAcs
dc.subjectPSProtcs
dc.subjectArabidopsis thalianacs
dc.subjecthitbodycs
dc.subjectPSProtcs
dc.subjectMolecular Biologyen
dc.subjectDNAen
dc.subjectRNAen
dc.subjectnucleotideen
dc.subjectamino-aciden
dc.subjectproteinen
dc.subjectdatabaseen
dc.subjectEBIen
dc.subjectENBL-Banken
dc.subjectSwiss-Proten
dc.subjectTrEMBLen
dc.subjectPDBen
dc.subjectEnSemblen
dc.subjectNeedlemann-Wunschen
dc.subjectPAM and BLOSUM matrixen
dc.subjectBLASTen
dc.subjectFASTAen
dc.subjectPSProten
dc.subjectArabidopsis thalianaen
dc.subjecthitpointsen
dc.subjectPSProten
dc.titleTechniky pro porovnávání biologických sekvencícs
dc.title.alternativeTechniques for Comparing Biological Sequencesen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2008-06-16cs
dcterms.modified2020-05-09-23:40:58cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid25434en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2020.05.10 01:15:49en
sync.item.modts2020.05.10 00:38:50en
thesis.disciplineInformační systémycs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémůcs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
771.25 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
review_25434.html
Size:
1.45 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_25434.html
Download
Collections
2008