Dynamický model produkce polyhydroxyalkonoátů termofilní bakterií S. thermodepolymerans

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D. (předseda) Ing. Marina Ronzhina, Ph.D. (místopředseda) Ing. Kateřina Jurečková (člen) Ing. Oto Janoušek, Ph.D. (člen) Mgr. Zdenka Fohlerová, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Janoušek položil dotaz na slowdown uzel v modelu. Prof. Provazník položil dotaz na využitelnost výsledků v praxi. Ing. Jurečková položila dotaz na tvorbu PHA ze vstupních substrátů. Studentka obhájila diplomovou práci a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykangličtina (English)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorSedlář, Karelen
dc.contributor.authorKřápková, Monikaen
dc.contributor.refereeŠafránek, Daviden
dc.date.accessioned2021-06-11T06:55:05Z
dc.date.available2021-06-11T06:55:05Z
dc.date.created2021cs
dc.description.abstractTato diplomová práce se zabývá rekonstrukcí dynamického modelu produkce polyhydroxyalkanoátů (PHA) termofilní bakterií Schlegelella thermodepolymerans. První kapitola poskytuje čtenářům krátký úvod do systémové biologie a matematické teorie grafů. Na ni navazuje druhá kapitola zabývající se různými přístupy v dynamickém modelování, včetně běžně používaných nástrojů pro dynamickou analýzu komplexních systémů. Třetí kapitola pak sleduje další pojmy a možnosti týkající se analýzy modelu. Následující kapitola se zaměřuje na metabolomiku a často používané laboratorní techniky a pátá kapitola je pak věnována polyhydroxyalkanoátům, zejména jejich chemické struktuře a vlastnostem. V kapitole šesté je navržen obecný booleovský model pro produkci PHA termofilními bakteriemi. Kapitola sedmá se poté zaměřuje na zdokonalení modelu se zaměřením na S. thermodepolymerans. Výsledný dynamický model je podroben analýze a výsledky jsou diskutovány.en
dc.description.abstractThis master's thesis deals with the reconstruction of a dynamic model for production of polyhydroxyalkanoates (PHA) by thermophilic bacterium Schlegelella thermodepolymerans. The first chapter provides readers with a brief introduction into the systems biology and mathematical graph theory. It is followed by Chapter Two dealing with different approaches in dynamic modelling, including the commonly used tools for dynamic analysis of complex systems. The third chapter then pursues further terms and possibilities regarding the model analysis. The following chapter focuses on metabolomics and the frequently used laboratory techniques and the fifth chapter is then occupied with polyhydroxyalkanoates, especially their chemical structure and properties. In Chapter Six, a general Boolean model for PHA production by thermophilic bacteria is proposed. Chapter Seven then aims at model refinement with focus on S. thermodepolymerans. The final dynamic model is analysed and the results are discussed.cs
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationKŘÁPKOVÁ, M. Dynamický model produkce polyhydroxyalkonoátů termofilní bakterií S. thermodepolymerans [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2021.cs
dc.identifier.other134424cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/197113
dc.language.isoencs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectSchlegelellaen
dc.subjectPHAen
dc.subjectDynamické modelováníen
dc.subjectMetabolomikaen
dc.subjectAnalýza rovnováhy tokuen
dc.subjectAnalýza atraktorůen
dc.subjectSchlegelellacs
dc.subjectPHAcs
dc.subjectDynamic modellingcs
dc.subjectMetabolomicscs
dc.subjectFlux balance analysiscs
dc.subjectAttractor analysiscs
dc.titleDynamický model produkce polyhydroxyalkonoátů termofilní bakterií S. thermodepolymeransen
dc.title.alternativeDynamic Model for Production of Polyhydroxyalkanoates by Thermophilic Bacterium S. thermodepolymeranscs
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2021-06-10cs
dcterms.modified2021-06-10-13:53:45cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid134424en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.10 14:16:09en
sync.item.modts2021.11.10 13:42:44en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.1 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
4.83 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_134424.html
Size:
9.22 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_134424.html
Download
Collections
2021