Vyhledávání homologních genů

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Jiří Jan, CSc. (předseda) Ing. Radovan Jiřík, Ph.D. (místopředseda) Ing. Miroslav Dvořák, CSc. (člen) MUDr. Eva Závodná, Ph.D. (člen) prof.Ing. Marek Penhaker, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Jiřík položil otázku: Popis bloku v algoritmu Reverzní průchod maticí. MUDr. Závodná položila otázku: Bylo testováno pouze na genech prokaryotických buněk? Ing. Penhaker položil otázku: Popis bodového diagramu na výstupu programu. Studentka obhájila bakalářskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programElektrotechnika, elektronika, komunikační a řídicí technikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorKubicová, Vladimíracs
dc.contributor.authorLýčková, Veronikacs
dc.contributor.refereeProvazník, Ivocs
dc.date.accessioned2019-05-17T03:28:51Z
dc.date.available2019-05-17T03:28:51Z
dc.date.created2014cs
dc.description.abstractTato diplomová práce se zabývá problematikou homologních genů a popisem molekulárně biologických databází, které slouží k jejich vyhledávání a vzájemnému porovnávání. Mezi nejdůležitější instituce, které se zabývají správou dat a jejich analýzou, patří EBI, NCBI a CIB. Pro vyhledávání homologních genů je nejzásadnější NCBI – Národní centrum pro biotechnologické informace. Bližší pozornost je věnována vyhledávacím algoritmům homologních genů jako jsou například blastn a PatternHunter. Praktická část této diplomové práce je pak realizace algoritmu srovnávajícího dvě sekvence a nacházejícího homologní geny, a to jak na základě sekvence nukleotidů, tak aminokyselin. Výsledky z vytvořeného programu budou dále konfrontovány s výsledky z komerčně dostupných programů.cs
dc.description.abstractThis diploma thesis deals with the description of homologous genes and molecular biological databases that are used for their search and allow comparison. Among the most important institutions that deal with data management and analysis, include the EBI, NCBI and CIB. For searching homologous genes is the most fundamental NCBI - National Center for Biotechnology Information. More attention is paid to the search algorithms of homologous genes such as BLASTN and PatternHunter. The practical part of this thesis is the implementation of the algorithm comparing two sequences and locating homologous genes. The comparison is made on the basis of the nucleotide sequence and amino acid sequence. The results generated from the program will be further compared with results from commercially available programs.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationLÝČKOVÁ, V. Vyhledávání homologních genů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2014.cs
dc.identifier.other73095cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/31583
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectHomologní genycs
dc.subjectNCBIcs
dc.subjectBLASTcs
dc.subjectPatternHuntercs
dc.subjectlokální zarovnánícs
dc.subjectglobální zarovnánícs
dc.subjectHomologous genesen
dc.subjectNCBIen
dc.subjectBLASTen
dc.subjectPatternHunteren
dc.subjectlocal alignmenten
dc.subjectglobal alignmenten
dc.titleVyhledávání homologních genůcs
dc.title.alternativeHomologous Gene Findingen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2014-06-10cs
dcterms.modified2014-06-13-13:05:26cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid73095en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 23:06:44en
sync.item.modts2021.11.12 22:06:48en
thesis.disciplineBiomedicínské a ekologické inženýrstvícs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.14 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
922.67 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_73095.html
Size:
5.39 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_73095.html
Download
Collections
2014