Analýza změn genomu C. necator po evoluční adaptaci

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Miloslav Pekař, CSc. (předseda) prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Petr Dzik, Ph.D. (člen) doc. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (člen) prof. Ing. Michal Veselý, CSc. (člen)cs
but.defenceObhajoba diplomové práce proběhla podle následujícího schématu: prezentace studenta-vyjádření vedoucí/ho-oponentský posudek-reakce na posudek-diskuse s komisí. Student přednesl výborný výtah výsledků své práce, řádně zodpověděl všechny dotazy oponentské i členů komise, pohotově reagoval na připomínky. V diskusi tak student prokázal výbornou schopnost orientace v teoretických i praktických základech problematiky práce. Komise zhodnotila jeho práci celkově jako výbornou. Otázky vznesené během diskuse: Veselý: Kde najdeme přílohy k vaší práci? Márová: Kde jste vzal sekvence stresovaných bakterií? Máte představu, jak e postupovalo při izolování DNA?cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programChemie a chemické technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorBrázda, Václavcs
dc.contributor.authorKroupa, Štěpáncs
dc.contributor.refereeObruča, Stanislavcs
dc.date.accessioned2020-08-26T07:58:52Z
dc.date.available2020-08-26T07:58:52Z
dc.date.created2020cs
dc.description.abstractTato práce se zabývá analýzou mutačních změn bakteriálních populací Cupriavidus necator H16 po evoluci za různých stresových podmínek. Tato analýza byla provedena zpracováním dat z metody sekvenování genomu „Next Generation Sequencing“, která byla provedena externí společností DNALink. Na základě bioinformatického postupu byl sestaven seznam mutačních změn pro každou adaptovanou populaci. Dále byly stanovené mutační změny asociovány s konkrétními oblastmi referenčního genomu Cupriavidus necator H16 z NCBI a analyzovány dle dostupných informací. Na závěr byl diskutován případný vliv stanovených mutací na produkci zásobních polymerů polyhydroxyalkanoátů.cs
dc.description.abstractThis bachelor’s thesis deals with analysis of mutations in bacterial populations of Cupriavidus necator H16 evolved in distinct stress conditions. This analysis was performed by processing data from the genome sequencing method „Next Generation Sequencing“, outsourced through the company DNALink. A list of mutations for each adapted population was constructed through bioinformatic methods. These mutations were then associated with specific areas of the reference Cupriavidus necator H16 genome from NCBI and analysed according to available information. Finally, the effect of these mutations on production of storage polymers polyhydroxyalkanoates was discussed.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationKROUPA, Š. Analýza změn genomu C. necator po evoluční adaptaci [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2020.cs
dc.identifier.other123816cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/194834
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemickács
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectCupriavidus necator H16cs
dc.subjectevoluční adaptacecs
dc.subjectstresové podmínkycs
dc.subjectpolyhydroxyalkanoátycs
dc.subjectnext generation sequencingcs
dc.subjectanalýza mutacícs
dc.subjectbioinformatikacs
dc.subjectCupriavidus necator H16en
dc.subjectevolutionary adaptationen
dc.subjectstress conditionsen
dc.subjectpolyhydroxyalkanoatesen
dc.subjectnext generation sequencingen
dc.subjectanalysis of mutationsen
dc.subjectbioinformaticsen
dc.titleAnalýza změn genomu C. necator po evoluční adaptacics
dc.title.alternativeAnalysis of C. necator genome changes after evolutionary adaptationen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2020-08-25cs
dcterms.modified2020-08-25-18:15:05cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta chemickács
sync.item.dbid123816en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 12:57:35en
sync.item.modts2021.11.12 12:02:26en
thesis.disciplineChemie pro medicínské aplikacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav fyzikální a spotřební chemiecs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.63 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
1.15 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_123816.html
Size:
9.46 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_123816.html
Download
Collections
2020