Přímá klasifikace metagenomických signálů ze sekvenace nanopórem

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Ivo Provazník, Ph.D. (předseda) Ing. Martin Vítek, Ph.D. (místopředseda) Ing. Jiří Chmelík, Ph.D. (člen) Mgr. Helena Durnová, Ph.D. (člen) Ing. Tomáš Potočňák (člen)cs
but.defenceStudent prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Potočňák položil otázku - Jsou výsledné Poincarého mapy vždy aproximovatelné elipsou? Student obhájil diplomovou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykslovenština (Slovak)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorSedlář, Karelsk
dc.contributor.authorLebó, Markosk
dc.contributor.refereeJugas, Robinsk
dc.date.accessioned2019-06-14T11:40:42Z
dc.date.available2019-06-14T11:40:42Z
dc.date.created2019cs
dc.description.abstractTáto diplomová práca sa venuje klasifikačným metódam metagenomických signálov, nezávislých na referenčnej databáze, ktoré sú získané sekvenáciou pomocou sekvenátora MinION. Popisuje ako vznik a druh dát, s ktorými sa v metagenomike pracuje, tak už existujúce metódy klasifikácie metagenomických dát nezávislých na referenčnej databáze. Rovnako je v tejto práci popísané, aký veľký prielom v metagenomike znamenalo objavenie sekvenácie DNA tretej generácie a konkrétne sa táto práca špecializuje na funkciu sekvenátora MinION od spoločnosti Oxford Nanopore. Cieľom práce bolo na základe modelových dát metagenómu navrhnúť a zrealizovať vlastnú metódu klasifikácie metagenomických dát získaných zo sekvenátora MinION a na záver ju porovnať s už existujúcou metódou klasifikácie.sk
dc.description.abstractThis diploma thesis deals with taxonomy independent methods for classification of metagenomic signals, aquired by a MinION sequencer. It describes the formation and character of metagenomic data and already existing methods of metagenomic data classification and their development. This thesis also evaluates an impact of the third generation sequencing techniques in the world of metagenomics and further specialises on the function of the Oxford Nanopore MinION sequencing device. Lastly, a custom method for metagenomic data classification, based on data obtained from a MinION sequencer, is proposed and compared with an already existing method of classification.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationLEBÓ, M. Přímá klasifikace metagenomických signálů ze sekvenace nanopórem [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2019.cs
dc.identifier.other118340cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/177632
dc.language.isoskcs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectmetagenomikask
dc.subjectsekvenácia tretej generáciesk
dc.subjectOxford nanoporesk
dc.subjectklasifikácia metagenomických dátsk
dc.subjectsquigglesk
dc.subjectmetagenomicsen
dc.subjectthird generation sequencingen
dc.subjectOxford nanoporeen
dc.subjectmetagenomic data clasificationen
dc.subjectsquiggleen
dc.titlePřímá klasifikace metagenomických signálů ze sekvenace nanopóremsk
dc.title.alternativeDirect Binning of Metagenomic Signals from Nanopore Sequencingen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2019-06-05cs
dcterms.modified2019-06-06-11:40:40cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid118340en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.10 14:15:52en
sync.item.modts2021.11.10 13:41:08en
thesis.disciplineBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.13 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
12.19 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_118340.html
Size:
5.89 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_118340.html
Download
Collections
2019