Metody analýzy pangenomu u bakteriálních populací
Bacterial Pan-Genome Analysis
| dc.contributor.advisor | Nykrýnová, Markéta | sk |
| dc.contributor.author | Lorková, Ema Marta | sk |
| dc.date.accessioned | 2022-06-16T06:52:10Z | |
| dc.date.available | 2022-06-16T06:52:10Z | |
| dc.date.created | 2022 | cs |
| dc.identifier.citation | LORKOVÁ, E. Metody analýzy pangenomu u bakteriálních populací [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2022. | cs |
| dc.identifier.other | 142072 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/205741 | |
| dc.description.abstract | Táto bakalárska práca sa zaoberá analýzou pangenómu u bakteriálnych populácií. V prvej časti je opísaný genóm, pseudogény, baktérie vrátane ich genómu, pangenóm a jeho súčasti. Uvedený je popis štyroch vybraných nástrojov na analýzu pangenómu. V praktickej časti je prevedené testovanie týchto nástrojov a porovnanie ich výstupov pre genóm danej baktérie. Nakoniec je navrhnutý algoritmus pre vlastnú metódu analýzy, opísaný je vlastný program a získané výsledky. | sk |
| dc.description.abstract | This bachelor thesis deals with pan-genome analysis for bacterial populations. The first part specifies genome, pseudogenes, bacteria and its genome, and pan-genome including its components. Following part introduces four tools for pan-genome analysis. Testing of these tools against specific bacterial genome and their comparison is mentioned in practical part. Lastly, an algorithm is implemented for creating new pipeline, and a code and obtained results are described. | en |
| dc.language.iso | sk | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | analýza pangenómu | sk |
| dc.subject | genóm | sk |
| dc.subject | baktéria | sk |
| dc.subject | pan-genome analysis | en |
| dc.subject | genome | en |
| dc.subject | bacteria | en |
| dc.title | Metody analýzy pangenomu u bakteriálních populací | sk |
| dc.title.alternative | Bacterial Pan-Genome Analysis | en |
| dc.type | Text | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2022-06-15 | cs |
| dcterms.modified | 2022-06-15-13:44:25 | cs |
| thesis.discipline | bez specializace | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrství | cs |
| thesis.level | Bakalářský | cs |
| thesis.name | Bc. | cs |
| sync.item.dbid | 142072 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2022.06.16 08:52:10 | en |
| sync.item.modts | 2022.06.16 08:15:44 | en |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií | cs |
| dc.contributor.referee | Škutková, Helena | sk |
| dc.description.mark | D | cs |
| dc.type.driver | bachelorThesis | en |
| dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
| but.committee | doc. Ing. Daniel Novák, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (místopředseda) Ing. Andrea Němcová, Ph.D. (člen) Ing. Helena Škutková, Ph.D. (člen) MUDr. Michal Jurajda, Ph.D. (člen) Ing. Martin Králík (člen) | cs |
| but.defence | Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Němcová se ptá na porovnání algoritmu s ostatními algortimy. Jak vznikl redukovaný dataset? Dají se výsledky generalizovat? MUDr. Jurajda se ptá jestli je výpočet náročný i na servrovém úložišti? Studentka obhájila bakalářskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta. | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| but.program | Biomedicínská technika a bioinformatika | cs |
| but.jazyk | slovenština (Slovak) |
Files in this item
This item appears in the following Collection(s)
-
2022 [397]