The evaluation of magnetic polymethacrylate-based microspheres used for solid phase DNA micro-extraction

Simple item page
dc.contributor.authorTrachtová, Štěpánkacs
dc.contributor.authorZapletalová, Hanacs
dc.contributor.authorŠpanová, Alenacs
dc.contributor.authorHorák, Danielcs
dc.contributor.authorKolářová, Hanacs
dc.contributor.authorRittich, Bohuslavcs
dc.coverage.issue2cs
dc.coverage.volume2cs
dc.date.accessioned2020-08-04T10:59:44Z
dc.date.available2020-08-04T10:59:44Z
dc.date.issued2015-04-02cs
dc.description.abstractUsing magnetic particles as a solid-phase extraction system is the most frequently used micro-technique for DNA isolation. Particles with a complete covering of magnetic cores by a polymer are hence preferred. Quantitative polymerase chain reaction (qPCR) was used for the evaluation of the polymer coating efficiency of hydrophilic magnetic poly(2-hydroxyethyl methacrylate-co-glycidyl methacrylate) (P(HEMA-co-GMA)) and poly(glycidyl methacrylate) (PGMA) microspheres with/without carboxyl groups. The inhibition effect of magnetic microspheres was identified by the shift in Cq values (Cq) after the addition of different amounts of microspheres to PCR mixtures. With the increase of microsphere concentrations, the shift in Cq values to higher values was usually observed. P(HEMA-co-GMA) microspheres containing carboxyl groups extinguished the fluorescence at concentrations over 2 mg mL1 in a PCR mixture without any influence on the synthesis of PCR products. No PCR products (inhibition of DNA amplification) were detected in the presence of more than 0.8 mg mL1 in the PCR mixture of PGMA microspheres. Atomic force microscopy (AFM) was used for the determination of the surface morphology of the microspheres. The microspheres were spherical, and their surface was non-porous.en
dc.description.abstractPoužití magnetických částic, jako extrakčního systému v pevné fázi, je jednou z nejčastěji využívaných mikro-technik pro izolaci DNA. Za tímto účelem jsou vyžadováyny částice s kompletním pokrytím magnetických jader polymerem. Metoda kvantitativní polymerázová řetězová reakce (qPCR) byla použita pro hodnocení účinnosti pokrytí povrchu hydrofilních magnetických poly (2-hydroxyethylmethakrylát-glycidylmethakrylát) (P (HEMA-co-GMA)) a poly (glycidylmethakrylát) (PGMA ) mikročástice s / bez karboxylových skupin polymerem. Inhibice účinku magnetických mikročástic byla sledována na základě posunu hodnot Cq (Cq) po přidání různých množství mikročástic do reakční směsi pro PCR. S nárůstem koncentrací mikročástic docházelo k posunu Cq hodnot (obvykle byly pozorovány vyšší hodnoty). P (HEMA-co-GMA) mikročástice na jejichž povrchu jsou obsaženy karboxylové skupiny způsobovaly zhášení fluorescence při koncentraci vyšší než 2 mg ml-1 a to bez jakéhokoliv vlivu na syntézu PCR produktů v PCR směsi. Žádné PCR produkty (inhibice amplifikace DNA) nebyly naopak detekovány v přítomnosti více než 0,8 mg ml-1 v PCR směsi PGMA mikročástic. Mikroskopie atomárních sil (AFM) byla použita pro stanovení povrchové morfologie mikročástic. Mikročástice byly kulovité a jejich povrch je neporézní.cs
dc.formattextcs
dc.format.extent156-166cs
dc.format.mimetypeapplication/pdfcs
dc.identifier.citationChromatography. 2015, vol. 2, issue 2, p. 156-166.en
dc.identifier.doi10.3390/chromatography2020156cs
dc.identifier.issn2227-9075cs
dc.identifier.other133348cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/188980
dc.language.isoencs
dc.publisherMDPIcs
dc.relation.ispartofChromatographycs
dc.relation.urihttp://www.mdpi.com/2227-9075/2/2/156cs
dc.rightsCreative Commons Attribution 4.0 Internationalcs
dc.rights.accessopenAccesscs
dc.rights.sherpahttp://www.sherpa.ac.uk/romeo/issn/2227-9075/cs
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/cs
dc.subjectmagnetické mikročástice
dc.subjectkvantitativní polymerázová řetězová reakce
dc.subjectinhibiční účinek
dc.subjectmikroskopie atomárních sil
dc.subjectmagnetic microspheresen
dc.subjectquantitative polymerase chain reactionen
dc.subjectinhibitory effecten
dc.subjectatomic force microscopyen
dc.titleThe evaluation of magnetic polymethacrylate-based microspheres used for solid phase DNA micro-extractionen
dc.title.alternativeHodnocení magnetických mikročástic na bázi polymethakrylátu vhodných pro mikro-extrakci DNA na pevné fázics
dc.type.driverarticleen
dc.type.statusPeer-revieweden
dc.type.versionpublishedVersionen
sync.item.dbidVAV-133348en
sync.item.dbtypeVAVen
sync.item.insts2020.08.04 12:59:44en
sync.item.modts2020.08.04 12:29:10en
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav chemie potravin a biotechnologiícs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
chromatography0200156.pdf
Size:
1.38 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
chromatography0200156.pdf
Download
Collections
Ústav chemie potravin a biotechnologií