Testování mikrometody izolace DNA z listů, plodů a výrobků z ovoce

Simple item page
but.committeeprof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (předseda) doc. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (místopředseda) doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Václav Brázda, Ph.D. (člen) doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D. (člen) RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D. (člen)cs
but.defence1. Diplomantka seznámila členy komise s náplní a cílem diplomové práce.2. Byly přečteny posudky na diplomovou práci.3. Diplomantka akceptovala všechny připomínky oponenta a na všechny otázky odpověděla v plné šíři.Diskuseprof. Márová: K čemu jste ve své práci využívala hybridizaci, k čemu by bylo možné jí dále využít? Je možné rodově specifikovat přímo konkrétní ovoce? Můžete specifikovat, jaký nový cycler jste ve své práci využívala?doc. Diviš: Můžete popsat, jakým způsobem probíhala vizualizace prováděných elektorforéz?doc. Brázda: Uvedla jste, že se jednalo o mikrometodu, jaké množství vzorku jste využívala? Která z využívaných metod izolace DNA dosahovala vyšších výtěžků a čistoty?Po diskuzi následovalo hodnocení závěrečné práce. Diplomantka prokázala výbornou orientaci v dané problematice i schopnost samostatné prezentace získaných výsledků.cs
but.jazykslovenština (Slovak)
but.programChemie a technologie potravincs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorKovařík, Alešsk
dc.contributor.authorBalažovičová, Nikolask
dc.contributor.refereeRittich, Bohuslavsk
dc.date.accessioned2019-06-14T11:40:00Z
dc.date.available2019-06-14T11:40:00Z
dc.date.created2019cs
dc.description.abstractDiplomová práca bola zameraná na testovanie mikrometódy izolácie DNA z listov, plodov a výrobkov z ovocia. Pre analýzu rastlinnej DNA v technologicky spracovaných potravinách boli vybraté džemy. Listy, plody a džemy boli homogenizované s použitím plastového kopistu v lyzačnom roztoku s 2% cetyltrimetylammonium bromidom (CTAB) s prídavkom 2,5M chloridu sodného (NaCl). Homogenáty boli použité pre izoláciu rastlinnej DNA metódou založenej na magnetických časticiach. Boli použité magnetické mikročastice poly(hydroxyethylmethakrylát-co-glycidylmethakrylát) – P(HEMA-co-GMA). Izolovaná DNA bola podrobená spektrofotometrickej analýze, kde bola zisťovaná jej koncentrácia a čistota. Následne bola testovaná amplifikovateľnosť rastlinnej DNA v polymerázovej reťazovej reakcii (PCR). Použité boli špecifické priméry pre rastlinnú ribozomálnu DNA - 18S_for a 5,8S_rev (produkt PCR - 700bp), 26S_for a 26S_rev (produkt PCR - 220 bp), 18S_for a 18-S_rev (produkt PCR - 263 bp). Boli optimalizované podmienky PCR a bol sledovaný vplyv dĺžky amplikónu na jeho detekciu. Produkty PCR boli detegované pomocou agarózovej gélovej elektroforézy. Bolo zistené, že z väčšiny listov je možné pomocou zvolených magnetických nosičov izolovať DNA v kvalite vhodnej pre PCR , na rozdiel od plodov. Z väčšiny testovaných džemov bola izolovaná DNA, ktorá sa amplifikovala v PCR s priméry dávajúcimi krátke produkty PCR. Metódu je treba ďalej optimalizovať.sk
dc.description.abstractThe thesis has been focused on testing of micromethod of DNA isolation from leaves, fruits and fruit products. Jams were selected for the analysis of plant DNA in technologically processed foods. Plant leaves, fruits, and jams were homogenized using plastic copist in a lysis buffer containing 2% cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) with 2.5M sodium chloride (NaCl). Microisolation of plant DNA was performed using poly(hydroxyethylmethacrylate-co-glycidylmethacrylate) – P(HEMA-co-GMA)microparticles. Isolated the DNA concentration and purity were assessed by UV light aborbance using a spectrophotometer. After that, amplification of the DNA was tested in PCR. Primers specific for plant ribosomal DNA: 18S_for a 5,8S_rev (PCR product - 700bp), 26S_for a 26S_rev (PCR product - 220 bp), 18S_for a 18¬S_rev (PCR product - 263 bp) were used. The PCR conditions were optimized and the effect of the amplicon length on its detection was followed. PCR products were detected by agarose gel electrophoresis. It was shown that DNA isolated from almost all of leaves using magnetic particles was in PCR-ready quality in contrary to the fruits. DNA amplified in PCR with primers giving short PCR products was isolated from almost all tested jams. The method must be optimalised, yet.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationBALAŽOVIČOVÁ, N. Testování mikrometody izolace DNA z listů, plodů a výrobků z ovoce [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2019.cs
dc.identifier.other115216cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/177449
dc.language.isoskcs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemickács
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectizolácia DNAsk
dc.subjectlistysk
dc.subjectplodysk
dc.subjectvysoko upravené potravinysk
dc.subjectdžemysk
dc.subjectmagnetické mikročasticesk
dc.subjectPCRsk
dc.subjectisolation of DNAen
dc.subjectleavesen
dc.subjectfruiten
dc.subjecthighly processed food productsen
dc.subjectjamsen
dc.subjectmagnetic microparticlesen
dc.subjectPCRen
dc.titleTestování mikrometody izolace DNA z listů, plodů a výrobků z ovocesk
dc.title.alternativeEvaluation of a micromethod for isolation of DNA from plant leaf, fruit and fruit productsen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2019-05-31cs
dcterms.modified2019-05-31-20:07:53cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta chemickács
sync.item.dbid115216en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 21:10:21en
sync.item.modts2021.11.12 20:01:32en
thesis.disciplinePotravinářská chemie a biotechnologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav chemie potravin a biotechnologiícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.49 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
review_115216.html
Size:
8.04 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_115216.html
Download
Collections
2019