but.committee	prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Jiří Jaroš, Ph.D. (místopředseda) Ing. Vítězslav Beran, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Lukáš Holík, Ph.D. (člen) Ing. Zbyněk Křivka, Ph.D. (člen)	cs
but.defence	Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A. Otázky u obhajoby: Můžete vysvětlit, proč v případech, kdy pro danou velikost úlohy existuje v databázi více měření, průměrujete výpočetní časy těchto měření? Proč nepočítáte třeba střední hodnotu? Jak se plánuje úloha, pro kterou plánovač nemůže použít žádná historická data v databázi? Mohl byste procentuálně vyjádřit, jak se liší naměřená data (výpočetní čas pro daný počet jader a velikost úlohy) od těch aproximovaných? Jak jsou od sebe body vzdáleny? Jak byste vyhodnotil, který aproximátor je v daném případě nejvhodnější, aby plánování a spuštění úlohy mohlo probíhat automatizovaně? Píšete, že by vaše aplikace mohla být v budoucnu používána nástrojem k-Dispatch. k-Dispatch je ale postaven na Pythonu 3.5. Je vaše aplikace zpětně kompatibilní, popř. jaké změny by bylo nutné implementovat? Jste u uvedeného článku spoluautorem?	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Informační technologie	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Jaroš, Jiří	cs
dc.contributor.author	Sasák, Tomáš	cs
dc.contributor.referee	Jaroš, Marta	cs
dc.date.accessioned	2020-07-14T07:59:32Z
dc.date.available	2020-07-14T07:59:32Z
dc.date.created	2020	cs
dc.description.abstract	Táto práca sa zaoberá plánovaním, resp. správnym odhadom spúšťacích konfigurácií úloh k-Wave na superpočítačoch infraštruktúry IT4Innovations. Presnejšie pre klastre Salomon a Anselm. Úloha predstavuje množinu simulácií, kde každá simulácia je spúšťaná pod toolboxom k-Wave. Pre spustenie jednotlivých simulácií je nutné správne vytvoriť konfiguráciu, ktorá sa skladá z množstva zdrojov (počet výpočtových uzlov, resp. jadier) a času rezervácie superpočítača, čo je pre neskúseného zložité odhadnúť. Zvolený problém odhadu je riešený na základe empirických dát, ktoré boli získané viacnásobným spúšťaním rôznych množín simulácií na klastroch. Tieto dáta sú uložené a spracované aproximátormi, ktoré konkrétne vykonávajú odhad týchto parametrov na základe metód interpolácie a regresie. V práci je popísaný a bol implementovaný systém predstavujúci plánovač, ktorý predstavuje rozhranie pre odhad. Experimentovaním bolo zistené že pre tento špecifický problém najpresnejšie odhady vykonáva trojica Akima spline, PCHIP interpolácia a kubický spline. Výsledky tejto práce umožňujú vykonávať istý odhad exekučného času a počtu vlákien pre ľubovolné simulácie automaticky a bez znalosti kódu k-Wave.	cs
dc.description.abstract	This thesis focuses on scheduling, i.e. correct approximation of configurations used to run k-Wave simulations on supercomputers from the IT4Innovations infrastructure. Especially, for clusters Salomon and Anselm. A single work is composed of a set which contains many simulations. Every simulation is executed by some code from the k-Wave toolbox. To calculate the simulation, it is necesarry to select a suitable configuration, which means the amount of supercomputer resources (number of nodes, i.e. cores), and the duration of the rental. Creation of an ideal configuration is complicated and is even harder for an inexperienced user. The approximation is made based on the empiric data, obtained from multiple executions of different sets of simulations on given clusters. This data is stored and used by a set of approximators, which performs the actual approximation by methods of interpolation and regression. The text describes the implementation of the final scheduler. By experimenting, the most efficient methods for this problem has found out to be Akima spline, PCHIP interpolation and cubic spline. The main contribution of this work is creation of a tool which can find suitable configuration for k-Wave simulation without knowing the code or having lots of experience with its usage.	en
dc.description.mark	A	cs
dc.identifier.citation	SASÁK, T. Optimalizace spouštěcích konfigurací k-Wave úloh [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2020.	cs
dc.identifier.other	129200	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/191550
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	superpočítač	cs
dc.subject	plánovač	cs
dc.subject	plánovanie	cs
dc.subject	dáta	cs
dc.subject	optimalizácia	cs
dc.subject	k-wave	cs
dc.subject	klaster	cs
dc.subject	salomon	cs
dc.subject	anselm	cs
dc.subject	experiment	cs
dc.subject	meranie	cs
dc.subject	predikcia	cs
dc.subject	it4i	cs
dc.subject	simulácia	cs
dc.subject	hpc	cs
dc.subject	pbs	cs
dc.subject	slurm	cs
dc.subject	aproximácia	cs
dc.subject	interpolácia	cs
dc.subject	regresia	cs
dc.subject	data-mining	cs
dc.subject	supercomputer	en
dc.subject	scheduler	en
dc.subject	scheduling	en
dc.subject	data	en
dc.subject	optimalisation	en
dc.subject	k-wave	en
dc.subject	cluster	en
dc.subject	salomon	en
dc.subject	anselm	en
dc.subject	experiment	en
dc.subject	measuring	en
dc.subject	prediction	en
dc.subject	it4i	en
dc.subject	simulation	en
dc.subject	hpc	en
dc.subject	pbs	en
dc.subject	slurm	en
dc.subject	approximation	en
dc.subject	interpolation	en
dc.subject	regression	en
dc.subject	data-mining	en
dc.title	Optimalizace spouštěcích konfigurací k-Wave úloh	cs
dc.title.alternative	Optimization of Run Configurations of k-Wave Jobs	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	bachelorThesis	en
dc.type.evskp	bakalářská práce	cs
dcterms.dateAccepted	2020-07-13	cs
dcterms.modified	2020-07-13-23:43:55	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta informačních technologií	cs
sync.item.dbid	129200	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2021.11.22 12:55:46	en
sync.item.modts	2021.11.22 12:16:07	en
thesis.discipline	Informační technologie	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémů	cs
thesis.level	Bakalářský	cs
thesis.name	Bc.	cs

Optimalizace spouštěcích konfigurací k-Wave úloh

Files

Original bundle

Collections