Klasifikace vzorků 1D gelové elektroforézy
Loading...
Date
Authors
ORCID
Advisor
Referee
Mark
B
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Tato diplomová práce se zabývá klasifikací vzorků 1D gelové elektroforézy. Popisuje teoretické informace týkající se gelové elektroforézy, různým druhům rušení, zpracování obrazu a jeho klasifikace pomocí shlukové analýzy. Jeden z hlavních úkolů je vytvoření databáze obrazů s ohledem na jejich co nejvyšší obrazovou kvalitu. Je realizována metoda předzpracování a detekce hranic jednotlivých vzorků v prostředí MATLAB. A konečně, je realizována klasifikace na základě shlukové analýzy vzorků, které je posléze statisticky ohodnocena.
This term project deals with the classification of 1D gel electrophoresis samples. It describes the theoretical information about gel electrophoresis, various types of errors, processing of the image and its classification using the cluster analysis. One of the main goals is creation of images with the highest quality as possible. A realization of pre-processing and detection of the sample borders is made in the MATLAB environment. And finally, classification of samples is done with subsequent statistical analysis.
This term project deals with the classification of 1D gel electrophoresis samples. It describes the theoretical information about gel electrophoresis, various types of errors, processing of the image and its classification using the cluster analysis. One of the main goals is creation of images with the highest quality as possible. A realization of pre-processing and detection of the sample borders is made in the MATLAB environment. And finally, classification of samples is done with subsequent statistical analysis.
Description
Citation
KRUPKA, O. Klasifikace vzorků 1D gelové elektroforézy [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínské inženýrství a bioinformatika
Comittee
prof. Ewaryst Tkacz, Ph.D.,D.Sc. (předseda)
Ing. Martin Vítek, Ph.D. (místopředseda)
doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (člen)
Ing. Jan Červený, Ph.D. (člen)
Mgr. Helena Durnová, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2015-06-09
Defence
Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky.
Doc. Kolářová položila otázku: Záleží umístění molekul na jejich velikosti? Jak? Jaká musí být vlastnost použitého gelu, aby metoda elektroforézy funguvala?
Ing. Červený položil otázku: Používal jste nějaky standard při tvorbě vzorků?
Student odpověděl na otázky členů komise a oponenta.
Student obhájil diplomovou práci.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení