Biofyzikální interpretace kvantitativního fázového zobrazení

but.committeeprof. Ing. Radimír Vrba, CSc. (předseda) prof. RNDr. Tomáš Šikola, CSc. (místopředseda) prof. RNDr. Pavel Zemánek, Ph.D. (člen) prof.RNDr. Michal Kozubek, Ph.D. (člen) Dr. Andreas Hoppe (člen)cs
but.defenceVýsledky disertační práce Ing. Štrbkové jsou vysoce aktuální v mezinárodním měřítku. Ukazují na jednu z možností biomedicínské aplikace rychle se rozvíjejících metod kvantitativního fázového zobrazování. Výsledky naznačují, že navržené přístupy budou využitelné nejen pro zvýšení spolehlivosti automatizované klasifikace živých buněk, ale také pro vyhodnocení buněčných dějů, například pro detekci různých typů buněčné smrti, různých stadií buněčného cyklu, buněčných transformací.cs
but.jazykangličtina (English)
but.programPokročilé materiály a nanovědycs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorChmelík, Radimen
dc.contributor.authorŠtrbková, Lenkaen
dc.contributor.refereeKozubek,, Michalen
dc.contributor.refereeHoppe, Andreasen
dc.date.accessioned2019-06-14T11:01:24Z
dc.date.available2019-06-14T11:01:24Z
dc.date.created2018cs
dc.description.abstractPráce se zabývá interpretací kvantitativního fázového zobrazení pomocí techniky koherencí řízené holografické mikroskopie. Vzhledem k tomu, že tato technika generuje velké množství kvantitativních fázových obrazů o nezanedbatelné velikosti, manuální analýza by byla časově náročná a neefektivní Za účelem urychlení analýzy obrazů získaných pomocí koherencí řízené holografické mikroskopie je v této práci navržena metodika automatizované interpretace kvantitativních fázových obrazů pomocí strojového učení s učitelem. Kvantitativní fázové obrazy umožňují extrakci parametrů charakterizujících distribuci suché hmoty v buňce a poskytují tak cennou informaci o buněčném chování. Cílem této práce je navrhnout metodologii pro automatizovanou klasifikaci buněk při využití této kvantitativní informace jak ze statických, tak z časosběrných kvantitativních fázových obrazů. Navržená metodika byla testována v experimentech s živými buňkami, jimiž byla vyhodnocena výkonnost klasifikace a významnost parametrů získaných z kvantitativních fázových obrazů.en
dc.description.abstractThis work deals with the interpretation of the quantitative phase images gained by coherence-controlled holographic microscopy. Since the datasets of quantitative phase images are of substantial size, the manual analysis would be time-consuming and inefficient. In order to speed up the analysis of images gained by coherence-controlled holographic microscopy, the methodology for automated interpretation of quantitative phase images by means of supervised machine learning is proposed in this work. The quantitative phase images enable extraction of valuable features characterizing the distribution of dry mass within the cell and hence provide important information about the live cell behaviour. The aim of this work is to propose a methodology for automated classification of cells while employing the quantitative information from both the single-time-point and time-lapse quantitative phase images. The proposed methodology was tested in the experiments with live cells, where the performance of the classification was evaluated and the relevance of the features derived from the quantitative phase image was assessed.cs
dc.description.markPcs
dc.identifier.citationŠTRBKOVÁ, L. Biofyzikální interpretace kvantitativního fázového zobrazení [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. CEITEC VUT. 2018.cs
dc.identifier.other103733cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/70207
dc.language.isoencs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. CEITEC VUTcs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectdigitální holografická mikroskopieen
dc.subjectkvantitativní fázový obrazen
dc.subjectstrojové učení s učitelemen
dc.subjectklasifikace buněken
dc.subjectdigital holographic microscopycs
dc.subjectquantitative phase imagecs
dc.subjectsupervised machine learningcs
dc.subjectcell classificationcs
dc.titleBiofyzikální interpretace kvantitativního fázového zobrazeníen
dc.title.alternativeBiophysical interpretation of quantitative phase imagecs
dc.typeTextcs
dc.type.driverdoctoralThesisen
dc.type.evskpdizertační prácecs
dcterms.dateAccepted2018-03-13cs
dcterms.modified2018-03-29-09:39:32cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyCEITEC VUTcs
sync.item.dbid103733en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.12 22:23:58en
sync.item.modts2021.11.12 20:59:04en
thesis.disciplinePokročilé nanotechnologie a mikrotechnologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. CEITEC VUT. Středoevropský technologický institut VUTcs
thesis.levelDoktorskýcs
thesis.namePh.D.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 5 of 6
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
3.06 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Vedouci prace-Posudek_vedouciho_Chmelik.pdf
Size:
941.18 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Vedouci prace-Posudek_vedouciho_Chmelik.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-Review AHoppe.pdf
Size:
2.26 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Oponent prace-Review AHoppe.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-Posudek_Kozubek.pdf
Size:
1.82 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Oponent prace-Posudek_Kozubek.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
thesis-1.pdf
Size:
2.06 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
thesis-1.pdf
Collections